antibacterial properties of bacteriocin purified from serratia marcescens and computerized assessment of its interaction with antigen 43 in escherichia coli

Bacteriocins are a kind of antimicrobial peptides that kill or inhibit the growth of bacterial strains. the purpose of this study was to investigate the antibacterial effect of serratia marcescens on several pathogenic bacterial strains. bacteriocin produced by s. marcescens was purified by chromatography with sephadex g-75 column, and its antibacterial effect on gram-negative bacteria, including escherichia coli atcc 700928, pseudomonas aeruginosa ptcc 1707, s. marcescens ptcc 1621, vibrio fischeri ptcc 1693, and vibrio harveyi ptcc 1755, were evaluated by the disk diffusion method. the structure of bacteriocin was determined by nuclear magnetic resonance spectroscopy. the interaction of bacteriocin with the antigen 43 (ag43) of e. coli was evaluated by the molecular docking method. bacteriocin extracted from bacterial isolates had antibacterial activity on e. coli strains but not on other studied strains. bioinformatics analysis also showed bacteriocin docking with ag43 with an energy of -159.968 kj/mol. natural compounds, such as bacteriocin, can be an alternative to common chemical compounds and antibiotics. to reach a definite conclusion in this regard, there is a need for further research and understanding of their mechanism of action.

خواص ضد باکتریایی باکتریوسین خالص شده از serratia marcescens و ارزیابی کامپیوتری تعامل آن با آنتی ژن 43 در اشریشیا کلی

باکتریوسین‌ها نوعی پپتید ضد میکروبی هستند که رشد سویه‌های باکتریایی را کاهش داده یا از آن جلوگیری می‌کنند. هدف از این مطالعه بررسی اثر ضد باکتریایی باکتریوسین serratia marcescens بر روی چندین سویه باکتریایی بیماریزا بود. باکتریوسین تولید شده توسط s. marcescens با کروماتوگرافی با ستون sephadex g-75 خالص شد و اثر ضد باکتریایی آن بر روی باکتری های گرم منفی از جمله escherichia coli atcc 700928، pseudomonas aeruginosa ptcc 1707، s. marcescens ptcc 1621، vibrio fischeri ptcc 1693 و vibrio harveyi ptcc 1755 با روش انتشار دیسک (ddm) ارزیابی شد. ساختار باکتریوسین توسط طیف سنجی nmr تعیین شد. برهمکنش باکتریوسین با آنتی ژن 43 (ag43) اشریشیا کلی به روش داکینگ مولکولی ارزیابی گردید. باکتریوسین استخراج‌شده از جدایه‌های باکتریایی دارای فعالیت ضدباکتریایی بر روی سویه‌های e. coli بود اما بر روی سایر سویه‌های مورد مطالعه فعالیت ضد باکتریایی نداشت. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک همچنین نشان داد که باکتریوسین با ag43 با انرژی 159.968- کیلوژول بر مول متصل است. ترکیبات طبیعی مانند باکتریوسین می توانند جایگزینی برای ترکیبات شیمیایی رایج و آنتی بیوتیک ها باشند. برای رسیدن به یک نتیجه قطعی در این زمینه، نیاز به تحقیقات بیشتر و شناخت مکانیسم عمل آنها وجود دارد.