bifidobacteriaceae family diversity in gut microbiota of patients with renal failure

Bifidobacteriaceae family are gut microbiota that exhibit probiotic or health promoting effects on the host. several studies have suggested that gut microbiot a are quantitatively and qualitatively altered in patients with chronic kidney disease (ckd) and end-stage renal disease (esrd). the present study aimed to assess the members of bifidobacteriaceae family in fecal samples of patients with ckd and esrd and compare them with non-ckd/esrd patients to find any changes in their counts and diversions in these patients. twenty fresh fecal samples from patients with ckd/esrd and twenty from non-ckd/esrd patients were examined. whole dna was extracted from fecal samples and the gut microbiota composition was analyzed by next generation sequencing (ngs). a total of 651 strains were identified from 40 fecal samples, 8 (1.23%) strains of which were identified as family bifidobacteriaceae. the most abundant species in both control and disease groups were bifidobacterium adolescentis and bifidobacterium longum subsp. longum, and the least abundant species in the disease group was bifidobacterium animalis subsp. lactis. there was no significant difference in the abundance of various species between the disease and control groups (p < 0.05). this study confirms that the members of the bifidobacteriaceae family are not altered in patients with ckd/esrd.

بررسی تنوع بیفیدوباکتریوم‌های میکروفلور روده‌ای در بیماران مبتلا به نارسایی مزمن کلیوی

باکتری‌های خانواده بیفیدوباکتریاسه عضو میکروفلور روده‌ای هستند که به عنوان پروبیوتیک بر سلامتی میزبان تاثیر بسزایی دارند. مطالعات متعدد حاکی از تغییر کمی و کیفی فلور روده‌ای افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیه (Chronic Kidney Disease, CKD) و یا بیماری انتهایی کلیه (EndStage Renal Disease, ESRD) است. مطالعه حاضر با هدف بررسی فراوانی و تنوع گونه‌های خانواده بیفیدوباکتریاسه در فلور مدفوع افراد مبتلا به CKD/ESRD و مقایسه آن با گروه شاهد طراحی گردید. بدین ‌منظور، 20 نمونه مدفوع از بیماران مبتلا به CKD/ESRD و نیازمند پیوند کلیه (گروه بیمار) و 20 نمونه نیز از بیماران کلیوی غیر ESRD (گروه شاهد) اخذ گردید. پس از استخراج DNA کامل نمونه‌ها، ترکیب میکروفلور آن‌ها با روش توالی‌یابی نسل جدید (Next Generation Sequencing, NGS) مورد شناسایی و آنالیز قرار گرفت. نتایج نشان داد که از مجموع 651 سویه باکتریایی شناسایی‌شده، 8 سویه (23/1 %) مربوط به خانواده بیفیدوباکتریاسه بودند. بیشترین فراوانی در هر دو گروه شاهد و بیمار متعلق به گونه‌های بیفیدوباکتریوم آدولسنتیس و بیفیدوباکتریوم لانگوم تحت‌گونه لانگوم و کمترین فراوانی در گروه بیمار مربوط به گونه بیفیدوباکتریوم انیمالیس تحت‌گونه لاکتیس بود. مقایسه میانگین فراوانی سویه‌های مختلف مشخص نمود که بین گروه شاهد و بیمار اختلاف معنی‌داری وجود ندارد (P < 0.05). یافته‌های این مطالعه نشان داد که باکتری‌های خانواده بیفیدوباکتریاسه در بیماران مبتلا به CKD/ESRD از نظر تنوع و تعداد تغییر چندانی نمی‌کنند. به نظر می‌رسد حضور گونه‌های مختلف خانواده بیفیدوباکتریاسه بر بهبود عملکرد کلیوی افراد بیمار تاثیر چندانی نداشته و شاید فقط گونه‌های خاصی از این خانواده بر عملکرد کلیوی بیماران به‌طور معنی‌داری موثر باشند.