|
|
molecular characterization and phylogenetic analysis of pathogenic theileria spp. isolated from cattle and sheep based on cytochrome b gene in iran
|
|
|
|
|
نویسنده
|
afshari a ,tavassoli m ,esmaeilnejad b ,habibi gh ,esmaeilnia k
|
منبع
|
archives of razi institute - 2021 - دوره : 76 - شماره : 2 - صفحه:243 -252
|
چکیده
|
The present study investigated the phylogenetic relationship based on cytochrome b gene sequences among pathogenic theileria species (spp.) in iran, including theileria annulata and theileria lestoquardi, along with other data available in genbank. a total of 136 (cattle) and 80 (sheep) blood samples suspected of piroplasm infection were obtained from six different provinces of iran. both microscopic and molecular methods using species-specific primers were used for screening t. annulata and t. lestoquardi positive samples. finally, the partial cytochrome b gene of 30 t. annulata and 5 t .lestoquardi were amplified, sequenced, and deposited in genbank. the results indicated that there were 12 different genotypes among t. annulata isolates, while only one genotype was observed among t. lestoquardi isolates. t. lestoquardi infection in cattle was detected in one sample, and no t. annulata and t. lestoquardi coinfection were detected in sheep and cattle. in the phylogenetic tree, different theileria spp. were placed in separate clades, and the reliability of depicted tree and monophyly of t. annulata and t. lestoquardi ingroups were supported by the bootstrap value of 94% which significantly indicated that these two species evolved from a common ancestor. the tree also showed that these two pathogenic spp. shared a more recent common ancestor, compared to another species of theileria parasites. to the best of our knowledge, this study is the first phylogenic analysis of pathogenic theileria spp. in iran based on the cytochrome b gene sequences. in addition, the first t. lestoquardi cytochrome b gene was sequenced and deposited in genbank.
|
کلیدواژه
|
cytochrome b ,iran ,multiplex pcr ,phylogeny ,theileria
|
آدرس
|
urmia university, faculty of veterinary medicine, department of pathobiology, iran. agricultural research, education and extension organization (areeo), razi vaccine and serum research institute, department of parasitic vaccines research and production, iran, urmia university, faculty of veterinary medicine, department of pathobiology, iran, urmia university, faculty of veterinary medicine, department of pathobiology, iran, agricultural research, education and extension organization (areeo), razi vaccine and serum research institute, department of parasitic vaccines research and production, iran, agricultural research, education and extension organization (areeo), razi vaccine and serum research institute, department of parasitic vaccines research and production, iran
|
پست الکترونیکی
|
kasra1341@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
بررسی خصوصیات ملکولی و فیلوژنتیک گونه های بیماریزای تیلریا در گاو و گوسفند در ایران بر اساس ژن سیتوکروم b
|
|
|
Authors
|
|
Abstract
|
در این مطالعه روابط فیلوژنتیکی بر اساس توالی ژن سیتوکروم b بین گونه های بیماریزای تیلریوز در ایران شامل تیلریا آنولاتا و تیلریا لستوکاردی همراه با سایر اطلاعات موجود در بانک ژن مورد بحث قرار گرفت. تعداد 136 نمونه خون (گاو) و 80 نمونه خون (گوسفند) مشکوک به آلودگی با پیروپلاسمها از شش استان مختلف ایران جمع آوری گردید. از دو روش میکروسکپی و ملکولی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی گونه برای غربالگری نمونه های مثبت تیلریا آنولاتا و تیلریا لستوکاردی استفاده گردید. در نهایت ژن سیتوکروم b در تعداد 30 نمونه تیلریا آنولاتا و 5 نمونه تیلریا لستوکاردی، تکثیر، تعیین توالی و در بانک ژن ثبت گردید. دوازده ژنوتیپ متفاوت در بین ایزوله های تیلریا آنولاتا بدست آمد در حالیکه تنها یک ژنوتیپ همسان در بین ایزوله های تیلریا لستوکاردی دیده شد. یک مورد آلودگی گاو با تیلریا لستوکاردی تشخیص داده شد و هیچ آلودگی توأم تیلریا آنولاتا و تیلریا لستوکاردی بدست نیامد. در درخت فیلوژنی، گونه های مختلف تیلریا در خوشه های جداگانه قرار گرفتند و اعتبار درخت ترسیم شده و مونوفیلی دو گونه آنولاتا و لستوکاردی با ارزش اعتبار سنجی بالاتر از 94% مورد تایید قرار گرفت. بعلاوه درخت فیلوژنی نشان داد که دو گونه بیماریزای اخیر با همدیگر از نظر زمانی، نیای مشترک نزدیکتری نسبت به سایر گونه های تیلریا دارند. بر اساس شواهد موجود این مطالعه اولین تحلیل فیلوژنی بر اساس توالی ژن سیتوکروم b در بین گونه های بیماریزای تیلریا در ایران می باشد. بعلاوه توالی این ژن در تیلریا لستوکاردی برای اولین بار تعیین و در بانک ژن ثبت گردید.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|