hemagglutinin-neuraminidase sequence and phylogenetic analysis of two newcastle disease virus isolated from chickens in iran

Newcastle disease is a highly contagious viral infection affecting many species of birds that can spread fast between poultry houses and cause a heavy economic burden on the poultry industry all around the world. fusion and hemagglutinin-neuraminidase (hn) protein are important in the pathogenesis of the newcastle disease virus (ndv). the hn protein is a critical viral protein with multiple functions and plays a key role in the formation of the virulence of ndv. head of hn protein is responsible for receptor binding, neuraminidase activity. this study aimed to investigate the sequence homology of hemagglutinin-neuraminidase of two ndv isolates sampled from infected farms in iran. the samples were collected from flocks that had been vaccinated by both types of live and killed vaccines for ndv. after isolation of ndv, the viruses were subjected to the polymerase chain reaction (pcr) amplification using two pairs of specific primers designed for the hn gene to amplify the complete hn gene (1730bp). afterward, the pcr products were sequenced and analyzed by phylogenetic tree construction software. based on the analysis, substantial sequence homology among iranian isolates is within the range of 97.1-100%. moreover, the sequence homology searching revealed a level of similarity between hn sequences of iranian isolates and the hn sequences from other countries, particularly asian ones. for instance, a high homology ratio (95.34%) was found between iranian isolates and the sequences registered on online molecular databases from china. based on phylogenetic analysis, the ndv isolates belong to the viid genotype. finally, it can be concluded that monitoring the circulation of ndvs among poultry and other birds can help to obtain an insight into the evolution of ndvs and control of panzootic viruses in the future.

تعیین توالی و آنالیز فیلوژنی ژن هماگلوتینین و نورآمینیداز دو ویروس نیوکاسل جدا شده از ماکیان در ایران

مقدمه: در 28 آبان ماه 1395 آنفلوانزای فوق حاد از یک مزرعه مرغ تخمگذار در شهرستان ملارد استان تهران گزارش شد. هدف: بررسی طغیانهای آنفلوانزای فوق حاد در ایران بود. روش کار: پرسشنامه‌ای برای بررسی بیماری تهیه شده و با مراجعه به مزارع و مصاحبه و مشاهده میدانی تکمیل شد. نتایج: طغیان آنفلوانزای H5N8 در 30 منطقه ( 10 روستا (3/33%)، 9 مزرعه تخمگذار ( 33%)، دو مزرعه مادر گوشتی ( 67/6%)، یک مزرعه مادر تخمگذار (3/3%)، یک مزرعه بوقلمون (3/3%)، یک مزرعه کبک (3/3%)، 5 پارک ملی (7/16%) و یک تالاب (3/3%) در12 استان شناسایی و تایید گردید. بروز تجمعی بیماری در روستاها، مزارع تخمگذار، مزارع مادر گوشتی، مزارع مادر تخمگذار، مزرعه کبک، و مزراع بوقلمون به ترتیب برابر 02/0%، 87/0%، 55/0%، 25/6%، و 69/0% بود. از بین متغیرهای بررسی شده ورود پرنده به خانه، وجود بازار زنده فروشی، وضعیت نامناسب امنیت زیستی، حمل و نقل کود در طول دوره پرورش، مشترک بودن مسیر با مزارع مبتلا و جابه‌جایی پولت به عنوان مهمترین عوامل خطر احتمالی با بیشترین فراوانی، مشاهده شدند. بحث: مطالعه دینامیک و جابهجایی طیور بومی در کشور، بررسی ساختار طیور صنعتی و اصلاح مشکلات مربوطه، اموزش روستائیان و پرورش دهندگان طیور بومی در گزارش تلفات و به خصوص در فصول پر خطر، آموزش پرورش دهندگان طیور صنعتی، کارگران آنها، کلینسینها و صنوف مربوطه، افزایش توجه مسوولین و به خصوص سیاست گزاران در خصوص اهمیت بیماری و تامین اعتبارات و امکانات مورد نیاز، از مهمترین اقدامات جهت پیشگیری و کنترل آنفلوانزای فوق حاد در کشور میباشد.