molecular detection of avian infectious bronchitis viruses in live bird markets, gilan province

Coronaviruses (avcov) which include infectious bronchitis virus (ibv) and other bird coronaviruses belong to the genus gammacoronavirus, subfamily coronavirinae. one of the most prominent representatives of gammacoronavirus genus is infectious bronchitis virus (ibv) which is a highly contagious viral pathogen of chickens causing considerable economic losses to the poultry industry. ibvs mostly affect the respiratory, urinary, and reproductive tracts leading to a substantial drop in production. backyard poultry in the villages usually share their food and water with free flight birds which puts them at serious risk of disease transmission. furthermore, the poor hygienic measurements which are often used in backyard flocks make them a potential reservoir for diseases that can be transferred to commercial poultry flocks. live bird markets (lbms) which receive live poultry to be resold or slaughtered and sold onsite play a significant role in spreading infectious diseases among the different bird species. in the present study, a number of 354 cloacal swab samples were collected from different bird species from lbms of gilan province. subsequently, after rna extraction, reverse transcriptionpolymerase chain reaction (rt-pcr) technique was carried out using specific primers of s1 gene to detect coronavirus infectious bronchitis virus. two samples from backyard chickens were reported to be positive to coronavirus which were named iran/backyardchicken96/2017 and iran/backyardchicken94/2017. the results of the phylogenetic analysis demonstrated that these two isolates are placed in qx and is-1494 strains, respectively. on a final note, the obtained results highlighted the role of live birds offered in lbms in the epidemiology of ibv and the transmission of the virus to the industrial flock.

شناسایی مولکولی ویروس‌های برونشیت عفونی پرندگان در بازارهای فروش پرندگان در استان گیلان

کرونا ویروس­های پرندگان (AvCoV) متعلق به جنس گاماکروناویروس، تحت خانواده­­­ کروناویریده و شامل ویروس برونشیت عفونی (IBV) و دیگر کرونا ویروس­های پرندگان هستند. یکی از برجسته­ترین گونه­های گاماکرونا ویروس­ها، ویروس برونشیت عفونی (IBV) است که یک پاتوژن ویروسی بسیارخطرناک در جوجه­ها محسوب می­شود و موجب ایجاد خسارات اقتصادی سرسام آوری در صنعت طیور می شود. ویروس­های برونشیت عفونی بیشتر روی دستگاه­های تنفسی، ادراری و تولید مثل تاثیر می­گذارند که منجر به کاهش قابل توجه تولید می شود. طیور محلی که در روستاها پرورش داده می­شوند و معمولا از آب و خوراکی  استفاده می­کنند که با پرندگان آزاد پرواز محیط مشترک می­باشد و این موضوع به طور بالقوه فرصت انتقال بیماری را به آنها می­دهد. علاوه بر این، مسائل بهداشتی ضعیفی که اغلب در گله­های کوچک محلی وجود دارد، این گله­ها را مخزنی بالقوه برای بیماری­هایی که می­توانند به گله­های تجاری منتقل شوند، می­سازد. بازارهای پرندگان زنده (LBMs)، محلی که پرندگان زنده را برای فروش و یا کشتار و فروش در محل به آنجا می آورند، نقش مهمی را در گسترش بیماری­های عفونی در میان گونه­های مختلف پرندگان ایفا می­کند. در این مطالعه 354 نمونه سواب کلواک از گونه­های مختلف پرندگان بازارهای استان گیلان جمع آوری شد و پس از استخراج RNA، از روش RTPCR و استفاده از پرایمرهای  اختصاصی ژن S1 به منظورشناسایی  کرونا ویروس­های عامل برونشیت عفونی  استفاده شد. آزمون کرونا ویروس دو نمونه از پرندگان محلی مثبت بود که  96/2017 Iran / Backyardchicken و Iran / Backyardchicken94/2017  نامیده شد و نتایج تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که این دو جدایه به ترتیب در سویه های QX و IS1494 قرار می­گیرند. نتایج این مطالعه نشان داد که پرندگان زنده بومی عرضه شده در بازارها. نقش مهمی در اپیدمیولوژی این بیماری و انتقال آن به گله­های صنعتی بازی می­کنند.