|
|
|
|
molecular detection of gamma coronaviruses in bird parks of iran
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
yaghoubi hannaneh ,ghalyanchilangeroudi a. ,karimi vahid ,ghafouri s. a. ,hashemzadeh m. ,hosseini h. ,fallah m. h. ,sadat mousavi f. ,najafi h.
|
|
منبع
|
archives of razi institute - 2019 - دوره : 74 - شماره : 4 - صفحه:349 -355
|
|
چکیده
|
Gamma coronaviruses (gcovs) are distributed worldwide, affecting a wide range of bird species, the beluga whale, and bottlenose dolphins. because of the limited proofreading capability in the viral encoded polymerase, they emerge genetically diverse. there has been no molecular surveillance data to describe the epidemiology of gcovs in avian species. the present study was conducted to detect gcovs in tehran birds’ parks, 2015. cloacal swabs (267 samples) from eight different bird species ((chickens (gallus gallus), pheasant (phasianus colchicus), turkey (meleagris gallopavo), partridge (perdix perdix), quail (coturnix coturnix), duck (anas platyrhynchos), goose (anserini),and guinea fowl (numididae)) were collected, the viral rna was extracted, the rt-pcr was performed using qiagen one step rt-pcr kit and the primers targeting “3'-utr” and “nucleocapsid” genes. the detection rate was approximately 8.99%. gcovs were detected in the chicken, quail, pheasant, turkey, and the partridge with different prevalence rates. phylogenetic tree based on partial nucleotide sequences of the n gene clustered the samples into two groups. it is the first report of gcovs in non-commercial birds in iran. according to our results, gcovs are circulating in different avian species, and further studies are needed to isolate these viruses and evaluate their pathogenesis.
|
|
کلیدواژه
|
gamma coronavirus ,molecular detection ,bird parks ,iran ,phylogenetic analysis
|
|
آدرس
|
university of tehran, faculty of veterinary medicine, department of microbiology and immunology, iran, university of tehran, faculty of veterinary medicine, department of microbiology and immunology, iran, university of tehran, faculty of veterinary medicine, department of avian diseases, iran, ferdowsi university of mashhad, faculty of veterinary medicine, department of clinical sciences, iran, agricultural research, education and extension organization (areeo), razi vaccine and serum research institute, department of poultry diseases, iran, islamic azad university, university of tehran, department of poultry diseases, iran, agricultural research, education and extension organization (areeo), razi vaccine and serum research institute, department of poultry diseases, iran, university of tehran, faculty of veterinary medicine, department of microbiology and immunology, iran, shiraz university, school of veterinary medicine, department of pathobiology, iran
|
|
پست الکترونیکی
|
hamideh.najafi.1988@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ردیابی کرونا ویروسها در پارک‌های پرندگان، ایران
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
Abstract
|
گاماکرونا ویروسها دارای گسترش جهانی بوده و طیف گسترده‌ای از گونه‌های پرندگان، وال سفید و دلفین‌ها را آلوده می‌سازند. این ویروسها به‌دلیل توانایی محدود تصحیحی پلیمراز ویروسی، از نظر ژنتیکی متنوع هستند. هیچگونه پایش مولکولی برای توصیف همه‌گیری‌شناسی گاما کرونا ویروسها در گونه‌های پرندگان وجود نداشته است. هدف این مطالعه حاضر ردیابی گاما کرونا ویروسها در پارک‌های پرندگان تهران در سال 2015 بود. سوآب‌های کلوآک (267 نمونه) از 8 گونه مختلف پرنده (مرغ، قرقاول، بوقلمون، کبک، بلدرچین، اردک، غاز و مرغ شاخدار) جمع آوری شدند،RNA ویروسی استخراج گردید و با استفاده از پرایمرهای هدف ژن‌های –"UTR’3 " و "نوکلئوکپسید" و کیتRTPCRیک مرحله‌ای کیاژن، RTPCRانجام شد. میزان ردیابی تقریبا 8.99 درصد بود. گاما کرونا ویروسها در مرغ، قرقاول، بوقلمون، کبک و بلدرچین با میزانهای شیوع متفاوت ردیابی شدند. درخت فیلوژنتیکی بر اساس توالی‌های نوکلئوتیدی بخشی از ژنN، نمونه‌ها را در دو گروه دسته‌بندی نمود. این اولین گزارش از گاما کرونا ویروسها در پرندگان غیر تجاری در ایران است. طبق نتایج ما گاما کرونا ویروسها در گونه‌های مختلف پرندگان در حال گردش بوده و برای جداسازی این ویروسها و ارزیابی بیماریزایی آن‌ها مطالعات بیشتری لازم است.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|