identification of non-tuberculosis mycobacteria by line probe assay and determination of drug resistance patterns of isolates in iranian patients

The potentially pathogenic non-tuberculosis mycobacteria (ntm) are emerging nowadays which result in pulmonary and non-pulmonary infections in human. this group of bacteria consists of at least 200 different species. while the pulmonary disease is the most common form of ntm infections, ntm can cause diffused infections as well as extrapulmonary infections in every organ, such as bone marrow, skin, eye, and brain. the ntm cause tuberculosis-like infections, therefore, correct identification of these mycobacteria is necessary to avoid faulty treatment. different species of ntm isolates were identified from clinical specimens using phenotypic methods and line probe assay. minimum inhibitory concentration for selected antibiotics was obtained by the broth micro-dilution method. totally, 42 ntm isolates were identified in this study. moreover, the frequency of ntm between all positive mycobacterium cultures was estimated at 12%. the most common rapidly growing mycobacteria included mycolicibacterium fortuitum (30.9%), mycobacterium abscessus (7.1%), and mycobacterium chelonae (2.3%), whereas mycobacterium simiae (40.4%), mycobacterium kansasii (16.6%), and mycobacterium avium complex (2.3%) were the most recurring among the slowly growing mycobacteria. amikacin, clarithromycin, and ciprofloxacin were the most effective antibiotics against isolated ntm. the ntm isolates are frequently being separated from iranian patients, and are mostly resistant to the wide spectrum of antibiotics. correct identification and determination of antibiotic susceptibility can be helpful in the healing process of the patients who suffer from non-tuberculosis mycobacterial infections.

شناسایی گونه‌های مایکوباکتریوم غیر سلی با روش Line Probe Assay و تعیین الگوی مقاومت دارویی جدایه‌ها در بیماران ایرانی

مایکوباکتریوم­های غیر سلی بیماری­زای بالقوه و در حال گسترش هستند. این باکتری­ها موجب عفونت­های ریوی و غیر ریوی شبه سل در انسان می­شوند. این گروه از باکتری ها شامل بیش از 200 گونه مختلف مایکوباکتریوم می­شوند. از این رو تشخیص صحیح عفونت های این گروه از باکتری ها برای اجتناب از شکست­های درمانی الزامی است. در حالی که عفونت های تنفسی شایعترین عفونت ایجاد شده با NTM ها می­باشند، این باکتری­ها سبب عفونت های خارج ریوی در مغز استخوان، خون، چشم و سایر اندام ها می­شوند. با استفاده از روش­های فنوتایپی و همچنین روش Line Probe Assay، گونه های مختلف مایکوباکتریوم­های غیر سلی از نمونه­های مختلف بیماران جداسازی و شناسایی شد. حداقل غلظت مهاری برای آنتی بیوتیک­های انتخاب شده با روش میکروبراث دایلوشن بدست آمد. در کل 42 گونه مایکوباکتریوم غیرسلی شناسایی شدند. نرخ شیوع مایکوباکتریوم های غیر سلی در میان تعداد کل نمونه های مایکوباکتریوم جدا شده از بیماران 12 درصد بود. شایع ترین گونه­های تند رشد مایکوباکتریوم شامل مایکوباکتریوم فورچیتوم (30.9%)، مایکوباکتریوم آبسه سوس (7.1%) و مایکوباکتریوم چلونه (2.3%) بودند. در حالیکه در میان گونه­های کند رشد، مایکوباکتریوم سیمیه (40.4%)، مایکوباکتریوم کانزاسی (%16.6%) و مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس (2.3%) بیشترین فراوانی را داشتند. آمیکاسین، کلاریترومایسین و سیپروفلوکساسین موثرترین آنتی بیوتیک ها علیه گونه های جدا شده بودند. گونه های مایکوباکتریوم­های غیر سلی با فراوانی قابل توجهی از بیماران ایرانی جداسازی می­شوند و اکثر این گونه ها به بسیاری از آنتی بیوتیک ها مقاوم هستند. شناسایی صحیح این گونه ها و تعیین الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی می­تواند در امر تشخیص و درمان بیماران ایرانی بسیار کمک کننده باشد.