|
|
بررسی و مقایسه میزان تغییرات نابجای متیلاسیون توالی dna پروموتوری ژن tlr4 در بیماران مبتلا به بیماری التهابی روده و افراد سالم
|
|
|
|
|
نویسنده
|
هاشمی مینا السادات ,پیشکار لیلا ,اسدزاده عقدائی حمید
|
منبع
|
journal of advanced biomedical sciences - 1399 - دوره : 10 - شماره : 3 - صفحه:2636 -2644
|
چکیده
|
زمینه و هدف: شیوع بیماریهای التهابی روده با توجه به گزارشهای وزارت بهداشت ایران رو به افزایش است. نقش عملکردی ژن tlr4 بهعنوان واسطه پاسخهای ایمنی ذاتی به میکروبهای بیماریزای دستگاه گوارش و ارتباط آن با تغییرات اپی ژنتیک در پاتوژنز این بیماری دارای اهمیت است. هدف ما بررسی تغییرات نابجای متیلاسیون توالی dnaپروموتوری ژن tlr4در بیماران التهابی روده و ارزیابی این ژن بهعنوان یک بیومارکر جهت تشخیص در این بیماری است.مواد و روشها: این مطالعه تجربی، از نوع موردشاهدی بر روی dna استخراجشده از خون محیطی 35 بیمار مبتلا به بیماریهای التهابی روده و 20 فرد سالم بهعنوان کنترل انجام گرفت. بهمنظور بررسی تغییرات متیلاسیون پروموتر توالی dna ژن tlr4 در بیماران مبتلا به بیماری التهابی روده و افراد سالم از تکنیک (hrm) high resolution melting استفاده شد.نتایج: طبق یافتههای حاصل از این مطالعه، تجزیهوتحلیل سطح متیلاسیون نواحی cpg پروموتور ژن tlr4، اختلاف آماری معنیداری در مقایسه بین 35 بیمار التهابی روده و 20 فرد سالم نشان نداد (0.525=p ). همچنین در این مطالعه تغییرات متیلاسیون در ارتباط با ویژگیهای کلینیکوپاتولوژیک انجام شد که ارتباط معناداری مشاهده نگردید. در مقایسه بین سطح متیلاسیون در قوم فارس نسبت به سایر قومهای کرد، لر، ترک، گیلانی، عرب، مازندرانی و افغان ارتباط معنادار مشاهده گردید (0.035=p ).نتیجهگیری: این مطالعه نشان داد که ارتباط معنیداری از مقایسه سطح متیلاسیون توالی پروموتوری ژن tlr4 در خون بین بیماران التهابی روده و افراد سالم وجود ندارد، لذا متیلاسیون توالی پروموتوری ژن tlr4 مارکری اختصاصی در خون محیطی جهت تشخیص و درمان بیماری التهابی روده نیست.
|
کلیدواژه
|
بیماریهای التهابی روده، ژن tlr4، متیلاسیون dna، real-time pcr ,high resolution melting
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد اسلامشهر, گروه زیستشناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد اسلامشهر, گروه زیستشناسی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی, پژوهشکده بیماریهای گوارش و کبد, مرکز تحقیقات علوم پایه و اپیدمیولوژی بیماریهای دستگاه گوارش, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evaluation and Comparison of Aberrant Methylation Changes in Tlr4 Gene Promoter DNA Sequencing in Patients with Inflammatory Bowel Disease and Healthy Individuals
|
|
|
Authors
|
هاشمی مینا السادات ,پیشکار لیلا ,اسدزاده عقدائی حمید
|
Abstract
|
Background Objective: According to the Iranian Ministry of Health prevalence of register‐identified inflammatory bowel disease among Iranian patients increased. The functional role of the TLR4 gene as a mediator of innate immune responses to pathogenic microbes in the gastrointestinal tract and its relationship to epigenetic changes is important. Our goal is to investigate the promoter DNA methylation of TLR4 gene in inflammatory bowel disease and to evaluate TLR4 gene as a biomarker to diagnose the disease.Materials Methods: In this casecontrol study, DNA was extracted from peripheral blood of 55 volunteers including 35 patients with IBD and 20 healthy controls. High resolution melting technique (HRM) was used to investigate the promoter methylation changes of TLR4 DNA sequence in patients with inflammatory bowel disease and healthy controls.Results: According to the results of this study, methylation level analysis of CpG regions of TLR4 promoter showed no significant difference between 35 inflammatory bowel patients and 20 healthy individuals (P = 0.525). Also in this study, methylation changes were performed in relation to clinicopathological features that no significant relationship was observed. A significant assocation was observed between the levels of methylation in Fars compared to other ethnic groups such as Kurdish, Lor, Turk, Gilani, Arab, Mazandaran and Afghan (= 0.035 P Value).Conclusion: This study showed that there is no significant relationship between the level of promoter methylation of TLR4 gene in the blood of patients
|
Keywords
|
Inflammatory bowel disease ,TLR4 gene ,DNA methylation ,Real-time PCR ,High resolution melting (HRM) ,Real-time qPCR ,(HRM) High resolution melting
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|