بررسی مقایسه‌ای ژن‌های کارباپنمازهای تیپ‌های kpc، vim، ndm وimp در ایزوله‌های بالینی و محیطی سودوموناس آئروژینوزا با پروتکل یکسان در روش real-time pcr

زمینه و هدف: تولید آنزیم‌های کارباپنمازی در ایزوله‌های سودوموناس آئروژینوزا جداشده از بالین، درمان عفونت‌های ناشی از این باکتری را به چالش کشانده است و با توجه به زیستگاه طبیعی این باکتری در محیط‌های آبی و خاکی، این مطالعه در نظر داشت ژن‌های کارباپنمازی kpc، vim، ndm وimp را با پروتکل یکسان برای چهار ژن فوق با روش real-time pcr در ایزوله‌های بالینی و محیطی مورد مقایسه قرار دهد.مواد و روش‌ها: ایزوله‌های بالینی از دو بیمارستان تبریز و ایزوله‌های محیطی از آب رودخانه‌های نهند و اسپیران جدا شد. جهت تعیین هویت ژنوتیپی آن‌ها، از پرایمر یونیورسال 16s rrna استفاده شد. با روش فنوتیپی دیسک دیفیوژن آگار و دیسک ترکیبی ازنظر تولید کارباپنمازها موردبررسی واقع شدند و با استفاده از پرایمر های اختصاصی برای ژن‌های موردنظر، مورد آزمون real- time pcr واقع شدند.نتایج: با روش فنوتیپی 83.3% ایزوله‌های بالینی و 0% از ایزوله‌های محیطی مولد کارباپنمازها بودند. درحالی‌که با روش real time pcr هم ایزوله‌های بالینی و هم محیطی ژن‌های bla ndm1، bla imp، bla kpc و bla vim را نشان دادند.نتیجه‌گیری: این مطالعه نشان داد که ژن‌های کارباپنمازی با یک پروتکل یکسان برای چهار ژن kpc، vim، ndm وimp قابل‌بررسی در ایزوله‌های بالینی و محیطی است و وجود ژن‌های فوق در ایزوله‌های محیطی علاوه بر ایزوله‌های بالینی اهمیت پخش این ارگانیسم را به‌عنوان super bug را بیش‌ازپیش روشن می‌سازد.

A Comparative Study of KPC-, VIM-, NDM- and IMP-Type Carbapenemase Genes in Clinical and Environmental Isolates of Pseudomonas aeruginosa Using Similar Protocol in Real-Time PCR Method

Background and objectives: Production of Carbapenemase enzymes in Pseudomonas aeruginosa isolated from clinic, has challenged the treatment of these infections and due to its natural habitat in soil and aquatic environments. This study aimed to compare carbapenemase resistance genes (VIM, KPC, NDM and IMP) using similar protocol for the four abovementioned genes in clinical and enviromemtal isolates by RealTime PCR.Materials and Methods: The clinical isolates were isolated from two Tabriz Hospitals and environmental isolates from Nahnad and Spiran rivers. For their genotypic idententification we used universal primer of 16s rRNA. They were investigated for Carbapenemase production via phenotypic disk agar diffusion and combined disk methods and then RealTime PCR was conducted using specific primers for the abovementioned genes.Results: By phenotypic methods, 83.3 percent of clinical and 0% of environmental isolates were Carbapenemase producers. However. both clinical and environmental isolates showed blaNDM1, blaIMP, blaKPC and blaVIM genes by RealTime PCR.Conclusion: This study showed that the carbapenemase enzymes rsquo; genes in clinical and environmental isolates were checked for four KPC, VIM, NDM and IMP genes by similar protocol and the presence of above genes in environmental isolates. Furthermore, clinical ones revealed the possibility of bacteria spreading as a superbug increasingly.