تعیین تفاوت ژن pepck-c به‌روش pcr-rflp و ارتباط آن با صفات عملکردی در مرغان بومی استان خراسان رضوی

این پژوهش با هدف تعیین تفاوت ژن pepckc در جمعیت مرغان بومی استان خراسان رضوی انجام گرفت. این ژن کد کننده آنزیمی با همین نام درون سلول های اغلب موجودات است. این آنزیم نقش کلیدی در چرخه نوسازی گلوکز (گلوکونئوژنز) دارد. دو نوع متفاوت از این ژن به شکل های نوع سیتوزولی (pepckc) و نوع میتوکندریایی (pepckm) وجود دارد. در این پژوهش نمونه های خون به طور تصادفی از 100 قطعه نژاد مرغ بومی منطقه خراسان رضوی جمع آوری شد. دی.ان.ای به روش نمکی بهینه یافته استخراج و سپس با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی، قطعه ای با طول 1000 جفت باز تولید شد. این قطعه از پیشبر تا اگزون شماره سه ژن pepckc را پوشش می دهد. به منظور تعیین ژنوتیپ های مختلف، روش pcrrflp با استفاده از آنزیم برشی bste pi; به کار گرفته شد. برای بررسی ارتباط تفاوت این ژن با صفات عملکردی از روش glm، نرم افزار sas استفاده شد. سه الگوی ژنوتیپی aa، abو bb به ترتیب با فراوانی 46/0، 35/0و 19/0 در این جمعیت مشاهده شد. تفاوت ژن pepckc اثر معنی داری بر صفات وزن تولد (01/0>p)، وزن در 12 هفتگی (0001/0>p) و میانگین وزن تخم مرغ بین 28 تا 32 هفتگی (002/0>p) داشت. اثر تفاوت این ژن روی دیگر صفات مورد پژوهش معنی دار نبود. براساس نتایج این پژوهش، پرندگان با ژنوتیپ bb بالاترین وزن تولد، وزن در 12 هفتگی و میانگین وزن تخم مرغ را داشتند. براساس نتایج این پژوهش انتخاب براساس تفاوت ژن pepckc می تواند در بهبود ژنتیکی صفات وزن بدن و وزن تخم مرغ در مرغان بومی خراسان رضوی موثر باشد.

Identification of PEPCK-C polymorphism using PCR- RFLP method and its association with economic traits in native fowl of Khorasan Razavi province

this study aimed to determine the PEPCKC gene polymorphism in a population of native fowl in Khorasan Razavi. This gene encodes an enzyme with the same name in most organisms. This enzyme plays a key role in the gluconeogenesis. There are two types of this gene namely, cytosolic (PEPCKC) and mitochondrial (PEPCKM) types. In this study, blood samples were randomly collected from 100 native fowl of Khorasan Razavi. DNA was extracted using modified salting out method and then a fragment with the length of 1000 bp using a pair of primers was amplified. This fragment covers the promoter and exon 3 of PEPCKC gene. For genotyping, the PCRRFLP method using the BstEII digesting enzyme was performed. The GLM procedure of SAS 9.1 was used to study the association of the PEPCKC gene polymorphism with economic traits. Three genotype patterns including AA, AB and BB were observed with frequencies of 0.46, 0.35 and 0.19, respectively. The effects of genotypes were significant for birth weight (P<0.01), weight at 12 weeks of age (P<0.0001) and average egg weight between 28 to 32 weeks of age (P<0.002). Other studied traits were not significantly influenced by genotypes of this gene. Based on the results of this study the BB genotype had the greatest impact on birth weight, weight at 12 weeks of age and average egg weight. Therefore, the selection based on the polymorphism of this gene could be useful for improving body weight and egg weight of Khorasan Razavi native fowl.