|
|
|
|
شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/ سدیم از غشای پلاسمایی گیاه kochia scoparia
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
نیکخواه ناهید ,فهمیده لیلا ,فولادوند زیبا
|
|
منبع
|
مهندسي ژنتيك و ايمني زيستي - 1395 - دوره : 5 - شماره : 2 - صفحه:113 -122
|
|
چکیده
|
یکی از راهکارهای گیاهان برای کاهش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرهای سمی سدیم در فرآیندهای سلولی سیتوزول می شود. ناقل های سدیم/هیدروژن غشای پلاسمایی (sos1) یکی از بهترین پروتئین های درگیر در این فرآیند هستند. در این پژوهش از گیاه دولپه و شورزی kochia scoparia به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر همین اساس با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاهان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلئوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسید آمینه ای از توالی کد کنندۀ این ژن شناسایی و تعیین توالی شد. میزان شباهت این توالی در سطح نوکلئوتیدی با حداکثر 84 درصد همولوژی و در سطح اسید آمینه ای 92 درصد با استفاده از بررسی blast تایید شد. تجزیه و تحلیل های بعدی برای تعیین خصوصیات پروتئینی و ارتباط آن با پروتئین های دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچ های آلفای آبگریز به عنوان قطعۀ گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنبالۀ با تعداد کمتر مارپیچ های آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعۀ داخل سلولی پروتئین می باشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل های غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تایید نمود.
|
|
کلیدواژه
|
جداسازی ژن، شوری، کوشیا، ناقل‌های غشای پلاسمایی
|
|
آدرس
|
دانشگاه زابل, دانشکده کشاورزی, گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه زابل, دانشکده کشاورزی, گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه زابل, پژوهشکده کشاورزی و پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Characterization and sequence of a hydrogen/sodium anti-porter gene in the plasma membrane of the plant Kochia scoparia
|
|
|
|
|
Authors
|
Nikkhah Nahid ,Fahmideh Leila ,Fooladvand Ziba
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|