شناسایی و همسانه سازی ژن داخلی مناسب پنبه در راستای افزایش کارایی بررسی های مولکولی

ژن داخلی مناسب در بررسی کیفیت dna ژنوم و آنالیز محصولات تراریخته از اهمیت فراوانی برخوردار است. در این پژوهش، به منظور دستیابی به ژن داخلی مناسب در پنبه، از ژن sadi استفاده شد. ابتداdna ژنومی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده با نرم افزار vector nti، واکنش pcr انجام گرفت. محصول واکنش pcr دو قطعه 623 و 544 جفت بازی بود. قطعات موردنظر در پلاسمید ptz57r/t همسانه شدند. پلاسمیدهای نوترکیب از طریق pcr کلونی با آغازگرهای اختصاصی و آغازگرهای m13 شناسایی شدند. در ادامه توالی یابی صورت گرفت. بررسی توالی نوکلئوتیدی نشان داد که این دو قطعه مربوط به نسخه های مختلف ژن sad1 هستند، که در نسخه اول یک حذف 79 جفت بازی در ناحیه اینترون دوم اتفاق افتاده است. این تحقیق، اولین گزارش از توالی یابی ژن داخلی است که با اثبات وجود دو نسخه متفاوت برای ژن sad1، می توان در مطالعات مختلف به عنوان ژن داخلی مناسب از آن استفاده کرد.