|
|
|
|
شناسایی in silico خانواده ژنی pld و بررسی الگوی بیان آن ها در پاسخ به تنش شوری در گیاه medicago truncatula
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
اللهی سمیه ,سوهانی محمدمهدی ,حسنی کومله حسن
|
|
منبع
|
مهندسي ژنتيك و ايمني زيستي - 1396 - دوره : 6 - شماره : 1 - صفحه:143 -156
|
|
چکیده
|
فسفولیپاز d (pld) و اسید فسفاتیک حاصل از آن نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای سلولی از جمله رشد و نمو و پاسخ به تنش دارد. pldها یک خانواده ژنی مهم را در گیاهان عالی تشکیل می دهند. که در آرابیدوپسیس، برنج و پنبه شناسایی شده اند. در این پژوهش 16 ژن pld در گیاه medicago truncatula l. شناسایی شد که براساس دمین های پروتئینی، روابط فیلوژنی، ساختار ژن و شباهت توالی به 6 گروه alpha (4 ژن)، beta (2 ژن)، gamma (2 ژن)، delta (3 ژن)، epsilon (2 ژن)، zeta (2 ژن) و phi (1 ژن) تقسیم شد. الگوی بیان ژن های mtpld4 و mtpld9 در زیرگروه alpha و ژن های mtpld13 و mtpld15 در زیر گروه beta;/ gamma تحت تنش شوریnacl با غلظت ds/m 23 در گیاهچه های چهار هفته ای m. truncatula l. با استفاده از qrtpcr بررسی شد. بیان mtpld4 در طی 48 ساعت نسبت به گیاه شاهد به طور معنی داری افزایش داشت. الگوی بیان mtpld9 و mtpld15 در ساعات اولیه روند افزایشی و سپس نسبت به گیاه شاهد کاهش بیان داشت. بیان mtpld13 در طی 48 ساعت کاملا روند کاهشی داشته و سرکوب شد. این نتایج نشان داد که زیرگروه alpha ژن های mtpld کاندیدای مهم و با ارزشی جهت آزمون های بعدی و مطالعات ژنومیکس کارکردی است.
|
|
کلیدواژه
|
اسید فسفاتیک، تنش شوری، فسفولیپاز، medicago truncatula، qrt-pcr
|
|
آدرس
|
دانشگاه گیلان, دانشکده کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه گیلان, دانشکده کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه گیلان, دانشکده کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
In silico identification of the PLD gene family and analysis of their expression pattern in response to salt stress in Medicago truncatula
|
|
|
|
|
Authors
|
Allahi Somayeh ,Sohani Mohammad Mehdi ,Hasani Kumleh Hasan
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|