|
|
|
|
گزارش وقوع و بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای مختلف لکه زرد خربزه از برخی از استانهای ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
صالح زاده مهرداد ,افشاریفر علیرضا
|
|
منبع
|
مهندسي ژنتيك و ايمني زيستي - 1403 - دوره : 13 - شماره : 2 - صفحه:225 -234
|
|
چکیده
|
طی یک بررسی در بهار و تابستان 1403، از گلخانه های اطراف شهر اصفهان، شیراز، بندرعباس، بوشهر و یزد در مرکز و جنوب ایران، لکههای زرد شدید، موزاییک و بدشکلی برگ، زردی، نکروز میوه و علائم لکههای حلقهای کلروتیک بر روی میوه گیاهان خیار کشتشده مشاهده شد. برای ارزیابی آلودگی جدایه ها به ارتوتوسپوویروس ها،rna ژنومی کل از هر منطقه 5 جدایه مستقل نمونه برداری شده بهصورت جداگانه استخراج شد و یک جدایه بدون علامت نیز به عنوان شاهد منفی انتخاب که بعدا توسط کارهای مولکولی عاری بودن آن از ارتوتوسپوویروس ها محرز گردید.. نمونههای rna استخراجشده متعاقباً با استفاده از یک جفت آغازگر دژنره ارتوتوسپوویروسها با آزمون rt-pcr مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج مولکولی تحقیقات نشان داد از نمونه های آلوده یک قطعه مورد انتظار با اندازه 420 جفت باز تکثیر شد. برای بررسی احتمال آلودگی مخلوط جدایه ها با ویروس های مهم بیمارگر در سبزیجات شامل توباموویروس ها، پوتکس ویروس ها، بگوموویروس ها و پوتی ویروس ها بررسی و مشخص گردید، جدایه های مورد بررسی آلودگی مخلوط با گروه های ویروسی مذکور نشان ندادند. زیرهمچینی توالی های نوکلئوتیدی جدایه های ایرانی و ترسیم درخت تبارنمای مربوطه آلودگی جدایه ها به ویروس لکه زرد خربزه را نشان داد. این اولین گزارش از وقوع ویروس لکه زرد خربزه (mysv) از ایران است.
|
|
کلیدواژه
|
ایران، اورتوتوسپوویروس، تنوع ژنتیکی، ویروس لکه زرد خربزه
|
|
آدرس
|
دانشگاه شیراز, مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی, ایران, دانشگاه شیراز, مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
afshari@shirazu.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
report on the occurrence and genetic diversity of melon yellow spot virus isolates in various provinces of iran
|
|
|
|
|
Authors
|
salehzadeh mehrdad ,afsharifar alireza
|
|
Abstract
|
in a survey conducted in spring and summer 2024 across greenhouses in isfahan, shiraz, bandar abbas, bushehr, and yazd, severe symptoms such as yellow spots, mosaic patterns, leaf deformity, yellowing, fruit necrosis, and chlorotic ring spots were noted on cultivated c. sativus plants. to assess contamination with orthotospoviruses, total genomic rna was extracted from five independent isolates from each area, along with an asymptomatic negative control, confirmed free of orthotospoviruses through molecular analysis. rt-pcr using degenerate primer pairs targeted orthotospoviruses, resulting in the amplification of a 420 bp fragment from infected samples. further investigations revealed no mixed contamination with significant pathogenic viruses including tobamoviruses, potexviruses, begomoviruses, and potyviruses. phylogenetic analysis based on nucleotide sequences indicated the presence of melon yellow spot virus. this marks the first recorded occurrence of melon yellow spot virus (mysv) in iran.
|
|
Keywords
|
iran ,orthotospovirus ,genetic diversity ,melon yellow spot virus
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|