شناسایی ریز‌rna‌های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود زراعی

نخود (cicer arietinum) یکی از مهمترین حبوبات است که حساس به سرما بوده و هر ساله کاهش ناگهانی دما منجر به افت عملکرد قابل توجه آن می شود. ریزrna ها، rna های کوچک غیررمزکننده بسیار محافظت شده ای هستند که بیان ژن را با تخریب mrna های هدف پس از رونویسی یا سرکوب ترجمه آنها تنظیم می کنند و نقش آن ها در پاسخ به سرما در گیاهان مختلف به اثبات رسیده است. در این مطالعه، به منظور شناسایی ریزrna های پاسخ دهنده به سرما، پس از توالی یابی ترانسکریپتوم در یک رقم متحمل (سارال) و یک لاین حساس به تنش سرما (ilc533)، توالی ژن های پاسخ دهنده به تنش سرما در نخود با استفاده ازنرم‌‌‌افزار c-mii مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. سپس، ژن های هدف تعدادی از ریزrna های مهم با استفاده از نرم افزار psrna target تعیین شدند. نتایج نشان داد که 30 ریزrna در ژنوتیپ متحمل و 20 ریزrna در ژنوتیپ حساس نخود به تنش سرما پاسخ دادند. با مقایسه پاسخ ریزrna ها در دو ژنوتیپ مورد بررسی، ریزrna هایmir159 ،mir319 ، mir393 و  mir394 به عنوان ریزrna های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود تعیین و نقش آنها مورد بررسی دقیق تر قرار گرفت. امید است نتایج به دست آمده در راستای ایجاد ارقام نخود متحمل به سرما مفید واقع شود.

identification of candidate micrornas involved in cold tolerance of chickpea

chickpea (cicer arietinum) is one of the most important legumes, classified as a cold-sensitive species, and each year, the sudden drop in temperature leads to a significant loss of chickpea yield. mirnas are highly conserved small noncoding rnas that regulate expression of their target genes by degradation of their mrnas or suppressing their translation, and their roles have been proved in cold stress response in various plants. in the current study, in order to identify cold stress responsive mirnas in chickpeas, following transcriptome sequencing of a cold stress tolerant cultivar (saral) and a cold stress sensitive line (ilc533) in response to cold stress, the sequences of the cold responsive genes were analyzed by c-mii software to identify possible mirnas. then, the target genes of a number of important mirnas were identified using psrna target software. the results showed that 30 and 20 mirnas responded to cold stress in the tolerant and sensitive genotypes, respectively. through comparative analysis of cold responsive mirnas in the contrasting genotypes, mir319, mir393, mir394 and mir159 were demonstrated as candidate mirnas involved in cold tolerance and their roles was further inspected. it is hoped that the obtained results will be useful for development of cold tolerant chickpea cultivars.