همسانه‌سازی و بررسی بیوانفورماتیکی cdna کد کننده فاکتور رونویسی myb44 آفتابگردان تحت تنش شوری

آفتابگردان دانه‌‌ روغنی (helianthus annuus l.) به طور گسترده در سراسر جهان کشت می شود. شوری خاک بر بسیاری از صفات مورفولوژیک و فیزیولوژیک آفتابگردان تاثیر منفی می گذارد. ژن‌های myb  بخشی از یک خانواده ژنی بزرگ از فاکتورهای رونویسی هستند که پروتئین‌های هسته‌ای را رمزگذاری می کنند و در مقاومت به شوری دخالت دارند. آفتابگردان روغنیِ متحمل به تنشِ شوری (as5305)، در محیط کنترل شده در قالب طرح کاملاً تصادفی با دو تکرار زیستی در شرایط نرمال و تنش شوری کشت شد. تنش شوری  هشت دسی زیمنس بر متر در مرحله هشت برگی از منبع nacl اعمال گردید. حدود 24 ساعت پس از اعمال تنش شوری نمونه برداری از برگ ها انجام گرفت. ژن‌‌ myb44، به عنوان یکی از ژن های دخیل در مقاومت به تنش شوری، در ناقل های بیانی p35s-n و p35s-g همسانه سازی شده و تجزیه بیوانفورماتیکی بر روی آن انجام گرفت. تجزیه و تحلیل توالی myb44 کلون شده به ترتیب بیش از 95% و 98% شباهت dna و پروتئین را بین ژن کلون شده با توالی myb44 در ncbi نشان داد که نشان‌دهنده حفظ شدگی توالی بالای این ژن در بین ژنوتیپ‌های مختلف آفتابگردان است. به طور کلی، نتایج مطالعه حاضر بالقوه راه را برای به نژادی مولکولی آفتابگردان برای مقاومت به شوری هموار می نماید.

cloning and bioinformatics analysis of the gene encoding transcription factor myb44 of sunflower (helianthus annuus l.) under salt stress conditions

sunflower oilseed (helianthus annuus l.) is widely planted around the world. soil salinity negatively affects many morphological and physiological traits of sunflowers. myb genes are a large gene family of transcription factors that encode nuclear proteins and involved in salinity resistance. oil seed sunflower line tolerant to salinity stress (as5305) was planted in normal and salinity stress conditions in a completely randomized design with two biological replications in a controlled environment. salinity stress of 8 ds.m-1 was applied in 8-leaf stage from nacl source. about 24 hours after salinity stress, leaves were sampled. the myb44 gene, as one of the genes involved in salinity stress resistance, was cloned in expression vectors p35s-n and p35s-g, and bioinformatics analysis was performed about it. analysis of cloned myb44 sequence revealed more than 95% and 98% dna and protein similarity respectively, between cloned gene with the myb44 sequence in the ncbi, indicating high sequence conservation of this gene among different sunflower genotypes. overall, the results of present study potentially pave the way for molecular breeding of sunflower for salinity resistance.