مطالعه ژن‌های کاندیدا موثر بر صفات دنبه در محدوده مشخصی از کروموزوم شماره 5 در گوسفندان لری بختیاری و زل با روش Pcr-Sscp

کیفیت گوشت و ترکیب لاشه از مهم ترین صفات اقتصادی در گوسفند به شمار می روند. چربی بدن و دنبه از جمله عواملتاثیرگذار بر کیفیت لاشه و گوشت تولیدی در هر نژاد بوده و وقوع جهش در توالی ژن های کنترل کننده این صفات می تواند عملکرد حیوان و بالطبع ارزش ارثی را تحت تاثیر قرار دهد. هدف از این مطالعه بررسی چند شکلی برخی نواحی از ژن های sar1b، sec24a و vdac1 در منطقه ژنومی کاندیدا برای صفات چربی و دنبه روی کروموزوم شماره 5 گوسفند بود. نمونه های خون به طور تصادفی از تعداد 300 راس گوسفند لری بختیاری و 100 راس گوسفند زل جمع آوری شد و استخراج dna به روش نمکی بهینه یافته انجام شد. واکنش های زنجیره ای پلیمراز (pcr) برای تکثیر قطعه های 478، 579 و 348 جفت بازی ژن های مورد مطالعه با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی، و تعیین ژنوتیپ نمونه ها با تکنیک sscp انجام شد. نتایج به دست آمده سه الگوی باندی a، b و c را برای ژن sar1b در گوسفند لری بختیاری نشان داد، اما این جایگاه ژنی در گوسفند زل تک شکل بود. برای ژن sec24a در هر دو نژاد سه الگوی باندی a، b و c، اما جایگاه vdac1 در دو نژاد تک شکل بود. تاثیر الگوهای باندی ژن sar1b بر ویژگی های دنبه معنی دار (p<0/001) بود، به طوری که الگوی باندی a بیشترین مقادیر مشاهده شده برای محیط بالا، محیط پایین، ارتفاع و وزن دنبه را نشان داد. الگوهای مختلف باندی ژن sec24a به طور معنی داری با ویژگی های دنبه در ارتباط بود (p<0/001) و الگوی باندی b بیشترین مقادیر را نشان داد. با توجه به تک شکل بودن جایگاه ژنی sar1b در نژاد بدون دنبه زل و چند شکل بودن آن در نژاد دنبه دار لری بختیاری و همچنین چند شکل بودن جایگاه ژنی sec24a در هر دو نژاد مورد مطالعه، این جایگاه های نشانگری را می توان به عنوان ژن های کاندیدای احتمالی موثر بر ویژگی های دنبه در نژادهای گوسفند دنبه دار مطرح کرد. مطالعه بیشتر نواحی دیگر (اگزون، اینترون و نواحی تنظیمی) این دو ژن و ارتباط آنها با صفات دنبه برای تایید نتایج پیشنهاد می شود.

Study of Candidate Genes Affecting Fat-Tail Traits in Specific Region of Chromosome 5 in Lori-Bakhtiari and Zel Sheep by PCR-SSCP

Meat quality and carcass composition are the most important economic traits in sheep. Body fat and fattail are key factors affecting carcass quality and meat production in each breed, and mutations in sequences of the genes that control these traits can affect the animal performance and therefore the breeding value. The aim of this study was to investigate the polymorphism in some regions of SAR1B, SEC24A and VDAC1 genes in candidate genomic regions for fat traits on ovine chromosome 5. Blood samples were collected randomly from 300 LoriBakhtiari and 100 Mazandaran sheep and DNA was extracted using modified salting out method. Polymerase chain reaction (PCR) was performed for amplification of 478, 579 and 348 bp fragments of studied genes using specific primer pairs and genotyping of samples was done by SSCP technique. The obtained results showed three banding patterns of A, B and C for SAR1B marker site in LoriBakhtiari sheep but it was monomorph in Zel sheep. For SEC24 gene, three banding patterns of A, B and C were observed in both sheep breeds, but VDAC1 was monomorph in both sheep breed. The effect of banding patterns of SAR1B gene on fattail characteristics were significant (P<0.001), so that the A banding pattern showed highest measurement of the upper and lower, height and weight of fattail. The band patterns of SEC24A gene significantly associated with fattail characteristics, and banding pattern of B showed highest values. Considering the monomorphic pattern of SAR1B gene in Zel sheep and polymorphic pattern in fattailed LoriBakhtiary sheep, and also polyomorphic patterns of SEC24A gene in both breeds, these two marker site could be considered as potential candidate genes affecting fat tail characteristic in fattailed sheep breeds. More studies on different parts of these genes (exon, intron, regulatory regions) and their association with fattail traits is recommended for confirmation if the results.