اثر خطای شجره بر وراثت پذیری و صحت پیش بینی ارزش اصلاحی در صفات آستانه ای

مقدمه و هدف: تشکیل کامل ماتریس روابط خویشاوندی، یک اصل مهم برای دستیابی به نتایج قابل اعتماد در ارزیابی های ژنتیکی می باشد. دو نوع خطای شجره شامل ثبت اطلاعات ناصحیح و گم شدن اطلاعات ثبتی منجر به کاهش قابلیت مدل دام در روش های سنتی می شود. هدف از مطالعه حاضر، اثر سطوح مختلف نقص اطلاعات شجره شامل پدری، مادری و هر دو والدین پدری و مادری به طور همزمان بر مقدار وراثت‎پذیری، صحت ارزیابی و پیش بینی ارزش اصلاحی در صفات آستانه ای بود.مواد و روش‌ها: صفتی محدود به جنس با وراثت‎پذیری 0/05، 0/1 و 0/2 ایجاد شد. به منظور ایجاد فنوتیپ های آستانه ای صفت چندقلوزایی، 20 درصد از فنوتیپ های بالا دو و 80 درصد باقی مانده یک در نظر گرفته شد. نسبت های مختلفی از نقص شجره پدری صفر، 5، 10، 15 و20 ، نقص شجره مادری صفر، 5 و 10 و ترکیبی از هر دو نقص شجره پدری و مادری به طور همزمان ایجاد شد. یک مدل آستانه ای در نظر گرفته شد. وراثت‎پذیری، ارزش های اصلاحی و صحت ارزیابی با روش آماری بیز برآورد شد.یافته ها: با معرفی سطوح مختلف نقص شجره به شجره کامل مقدار وراثتپذیری کاهش یافت. برای وراثت پذیری 05 / 0 ، 1 / 0 و 2 / 0 کمترین مقداروراثتپ ذیری به دست آمده به ترتیب 018/ 0 ، 084/ 0 و 16/ 0 بود. در شجره کامل، کمترین و بیشترین مقدار صحت ارزیابی به ترتیب 375/ 0 05 / 0 = ℎ^2 و 521/ 0 2/ 0 = ℎ^2 بود. کمترین مقدار صحت ارزیابی برای وراثت پذیری 05/ 0 ، 1/ 0 و 2/ 0 به ترتیب 309/ 0 نقص شجره ی پدری 10 درصد و مادری 10درصد ، 353 / 0 نقص شجره ی پدری 20 درصد و مادری 10 درصد و 459/ 0 نقص شجره ی پدری 5 درصد و مادری 10 درصد بود. همچنین معرفی نقص شجره در سطوح مختلف منجر به کاهش میانگین ارزش اصلاحی شد.نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد، در مقایسه با نقص شجره ی پدری یا مادری به صورت مجزا، نقص شجره ی پدری و مادری به صورت تواما، برآورد ارزیابی های ژنتیکی را بیشتر کاهش می دهد.  

the effect of pedigree error on heritability and accuracy of prediction of breeding value in threshold traits

extended abstractintroduction and objective: complete information of relationship matrix is ​​an important principle to achieve reliable results in genetic evaluations. two kinds of pedigree errors, including incorrect pedigree information and missing pedigree information, reduce the capability of the livestock model in traditional methods. the purpose of this study was to investigate the different levels of missing pedigree information such as sire, dam and both parents sire and dam together on heritability, accuracy of prediction and estimation of breeding value in threshold traits.material and methods: sex-limited traits with heritability of 0.05, 0.1, and 0.2, were simulated. in order to create threshold phenotypes of litter size, 20% of the top-phenotypes were considered as two and the rest were considered as one. different ratios of missing sire information zero, 5, 10, 15 and 20 , missing dam information zeros, 5 and 10 and a combination of both missing information sire and dam together were created. a threshold model was considered. heritability, breeding values ​​and accuracy of prediction were calculated by bayesian statistical method.results: with the introduction of different levels of missing pedigree information to the complete pedigree, the amount of heritability decreased. the lowest values ​​of heritability were 0.018, 0.084 and 0.16 for heritability of 0.05, 0.1 and 0.2, respectively. in the complete pedigree, the lowest and highest accuracy of prediction were 0.375 h2 =0.05 and 0.521 h2 =0.2 , respectively. the lowest values of accuracy of prediction for heritability of 0.05, 0.1, and 0.2 were 0.309 30% in paternal pedigree defects and 10% in maternal pedigree defects , 0.353 paternal pedigree defects 20% and maternal pedigree defects 10% , and 0.459 5% defect in paternal pedigree and 10% defect in maternal pedigree , respectively. furthermore, missing pedigree information led to a decrease in the average breeding value.conclusion: the results showed that, compared to the paternal or maternal missing pedigree information separately, paternal and maternal missing pedigree information together, further reduces the estimation of genetic evaluations.