بررسی چندشکلی تعدادی از نشانگرهای ریزماهواره (microsatellite) در یک جمعیت از گوسفندان بلوچی

نظر به اهمیت حفظ و نگهداری نژادهای بومی به‌عنوان ذخایر ژنتیکی کشور، نژاد گوسفند بلوچی به‌عنوان پرجمعیت‌ترین نژاد گوسفند ایرانی و داشتن شجره قابل‌اطمینان، انتخاب شد. در این تحقیق با استفاده از 15 نشانگر ریزماهواره (tgla231, oarvh110, mcma10, mcma1, mcm214, mcm139 mcm63, lscv38, lscv36, kd101, bms2721, bms995, bms332, bm1815, bm737 ( تنوع ژنتیکی در یک جمعیت از گوسفند بلوچی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 140 راس دام از ایستگاه عباس‌آباد مشهد به‌صورت تصادفی انتخاب‌ شدند. پس از انجام واکنش‌های pcr، جایگاه mcm139 به هیچ‌کدام از شرایط بهینه‌سازی تکثیر جواب نداد. جایگاه lscv38 به علت داشتن آلل صفر زیاد و عدم وضوح آللی مورد استفاده قرار نگرفت. بقیه جایگاه‌ها در جمعیت مورد مطالعه چند شکل بودند. تعداد آلل های مشاهده‌شده از 6 آلل در جایگاه‌های bm737، bms332، mcma10 تا 12 آلل در جایگاه mcm63 و آلل موثر از 3.51 در جایگاه lscv36 تا 8.66 در جایگاه oarvh110 متغیر بودند. بیشترین هتروزایگوسیتی مورد انتظار در جایگاه oarvh110با 12 آلل و به مقدار (0.890) و کمترین آن در جایگاه lscv36 (0.718) با 7 آلل مشاهده شد. بیشترین محتوای اطلاعاتی چندشکلی (pic) در جایگاه oarvh110 (0.873) و کمترین مقدار این معیار در جایگاه lscv36 (0.669) بود. بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون به ترتیب برای جایگاه oarvh110 (2.21) و lscv36 (1.47) برآورد شد. با توجه به نتایج، جایگاه‌های ریزماهواره مورداستفاده از چندشکلی بالایی در جمعیت گوسفند بلوچی برخوردار بودند و می‌توان از چندشکلی بالای آنها در مطالعات بعدی، به‌ویژه برای یافتن جایگاه‌های صفات کمی استفاده نمود. وجود آلل ها و دامنه آللی جدید در این نژاد حاکی از تفاوت ساختار جمعیتی آنها در مقایسه با گوسفندان نژاد‌های خارجی است.

Investigation of Polymorphism of Some Microsatellite Markers in Baluchi Sheep Population

Due to the importance of conservation and preserving indigenous breeds, Baluchi sheep as the most populous breed of Iranian sheep with reliable pedigree was selected. In this study genetic variations were analyzed with 15 microsatellites markers (BM737, BM1815, BMS332, BMS995, BMS2721, KD101, LSCV36, LSCV38, McM63, McM139, McM214, McMA1, McMA10, OarVH110, TGLA231) in a population of Baluchi sheep. Whole blood samples were randomly collected from 140 sheep at Abbas Abad Breeding Station (Mashhad). After PCR reactions, McM139 locus wasn't amplified and LSCV38 locus was ignored for many null Alleles. Thirteen microsatellites loci were %100 polymorphic. Number of alleles, observed and expected heterozygosity, polymorphic information content (PIC) and Shannon index were calculated. Highest and lowest allele numbers was observed in OarVH110 locus with 12 alleles and 6 alleles in BM737, BMS332, McMA10, respectively. Effective number of allele was between 3.51 (LSCV36) to 8.66 (OarVH110). The highest and the lowest heterozygosity belonged to 0.89 (OarVH110) and 0.71 (LSCV36), respectively. OarVH110 locus indicated the highest PIC (0.873) and LSCV36 locus indicated the lowest PIC (0.669). The highest and lowest Shannon index were belonged to 2.21 (OarVH110) and 0.66 (LSCV36), respectively. These results verify high efficiency of microsatellites marker for screening of population's structure in Iranian native sheep and in future study for QTL mapping. So, presence of new alleles and allele range indicates difference between Baluchi sheep population structure with foreign Sheep breeds.