|
|
بررسی ساختار ژنتیکی و دقت انتساب افراد به پنج جمعیت اسب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
|
|
|
|
|
نویسنده
|
سید شریفی رضا ,بادبرین سجاد ,خمیس آبادی حسن ,هدایت ایوریق نعمت ,سیف دواتی جمال
|
منبع
|
پژوهشهاي توليدات دامي - 1398 - دوره : 10 - شماره : 24 - صفحه:120 -126
|
چکیده
|
در بعضی موارد به دلیل هم پوشانی صفات ظاهری و عدم ثبت اطلاعات والدینی، تعیین نژاد یک اسب با مشکل مواجه می شود. استفاده از روش های مولکولی انتساب افراد به جمعیت اولیه می تواند کمک قابل توجهی در این زمینه باشد. تحقیق حاضر با هدف بررسی ساختار ژنتیکی و میزان دقت انتساب اسب ها به جمعیت های مبداء با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انجام گرفت. برای این منظور از 165 راس اسب شامل نژادهای کاسپین (35 نمونه)، عرب (36 نمونه)، ترکمن (30 نمونه) و تاروبرد (28 نمونه) و یک جمعیت آمیخته ترکمن تاروبرد (36 نمونه) به صورت تصادفی نمونه خون تهیه شد. واکنش زنجیره ای پلی مراز با استفاده از 12 نشانگر ریزماهواره توصیه شده توسط انجمن جهانی ژنتیک حیوانی (isag) انجام و محصولات حاصله روی ژل اکریل آمید 8 درصد تفکیک و با استفاده از رنگ آمیزی نیترات نقره نمایان شد. برآورد متغیرهای ژنتیکی مانند تعداد آلل موثر و میزان هتروزیگوسیتی مورد انتظار نشان دهنده تنوع ژنتیکی قابل توجهی در نشانگرهای مورد استفاده بود. از میان نشانگرهای بررسی شده، نشانگر aht4 با 11.20 آلل بیشترین و نشانگر aht5 با 4.28 آلل کمترین تعداد آلل موثر و نشانگر aht4 (0.82) بیشترین و نشانگر asb17 (0.67) کمترین میزان تنوع ژنتیکی را نشان دادند. بیشترین و کمترین میزان فاصله ژنتیکی بین نژاد تاروبرد و نژادهای عرب و کاسپین (0.91) و نژاد تاروبرد با جمعیت آمیخته (0.10) محاسبه شد. در مجموع نشانگرهای مورد استفاده توانستند 79 درصد از افراد را به درستی به جمعیت مبدا منتسب نمایند. بنابراین نشانگرهای ریزماهواره در برخی موارد کمک خوبی جهت تعیین منشاء نژادی اسب های کشور هستند.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، آزمون انتساب، اسب های خالص، نشانگرهای ریزماهواره
|
آدرس
|
دانشگاه محقق اردبیلی, گروه علوم دامی, ایران, مرکز تحقیقات کرمانشاه, گروه علوم دامی, ایران, مرکز تحقیقات کرمانشاه, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, گروه علوم دامی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Study of Genetic Structure and Accuracy of Assignment of Individuals to Five Horse Populations using Microsatellite Markers
|
|
|
Authors
|
seyedsharifi reza ,badbarin sajad ,khamisabadi hassan ,hedayat evrigh nemat ,seif davati jamal
|
Abstract
|
In some cases, due to overlapping of morphological traits and parents incomplete recording information, it is difficult to determine the breed origin of a horse. The use of molecular methods for assigning individuals to their breed can be a significant help in this regard. The present study was conducted to investigate the genetic structure and the accuracy of the assignment of horses to the origin populations using microsatellite markers. For this purpose, samples from 165 horses including Caspian (35), Arabian (36), Turkoman (30), Thoroughbred (28) and Turkoman Thoroughbred crossbred population (36) were randomly collected. Polymerase chain reaction was performed using 12 microsatellite markers recommended by the International Society for Animal Genetics (ISAG), and the PCR products were separated by 8% acryl amide gel and stained using silver nitrate staining procedure. Estimation of genetic parameters such as the number of effective alleles and the expected heterozygosity level showed a high genetic variation in the used markers. Among them AHT4 marker showed the highest (11.20 alleles) and the AHT5 showed the lowest (4. 28) effective alleles and AHT4 (0.82) showed the highest and ASB17 (0.67) showed the lowest genetic variation. The highest and lowest genetic distances were observed between Thoroughbred with Arabian and Caspian (0.91) and Thoroughbred with crossbred population (10.0). In conclusion, the markers used in this study, could correctly assign 79% of the individuals to their source populations. Therefore, in some cases microsatellite markers can be a helpful tool for determining the breed origin of the horse.
|
Keywords
|
Assignment Tests ,Genetic Diversity ,Microsatellite Markers ,Purebred Horses
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|