برآورد صحت انتخاب ژنومی در جوامع کوچک ژنتیکی- مطالعه‌ شبیه‌سازی

در پژوهش حاضر برای ارزیابی تاثیر منابع مختلف اطلاعات جوامع خارجی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی حیوانات جوان در جمعیت کوچک، دو جمعیت کوچک و بزرگ گاو شیری شبیه سازی گردید. یک جمعیت بزرگ متشکل از 200 هزار حیوان طی 15 نسل و سپس یک جمعیت کوچک متشکل از 5 هزار حیوان طی3 نسل به کمک نرم افزار qmsim به گونه ای ایجاد شدند که دو جمعیت از لحاظ ژنتیکی مرتبط بودند. براساس منابع مختلف اطلاعات در دسترس سه راهبرد برآورد صحت ارزیابی های ژنومی تعریف گردید. در راهبرد اول، صحت های ارزش های اصلاحی ژنومی براساس ارزش های ژنومی دام ها در جمعیت کوچک برآورد گردیدند. در راهبرد دوم، صحت های ارزش های اصلاحی حیوانات به کمک اطلاعات دام ها در جمعیت کوچک و نیز ارزش های اصلاحی ژنومی دام های نر جمعیت بزرگ برآورد شدند. در راهبرد سوم، اطلاعات فنوتیپی، ژنوتیپی و شجره دام ها جمعیت بزرگ برای برآورد صحت ها یا ارزش های اصلاحی ژنومی دام ها جمعیت کوچک استفاده شد. میانگین های صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی در راهبردهای اول، دوم و سوم به ترتیب 34/ 0، 40/ 0 و 50/ 0 به دست آمد. همچنین میانگین های ضریب پیش بینی رگرسیونی در راهبردهای اول، دوم و سوم به ترتیب 74/ 0، 83/ 0 و 93/ 0 برآورد گردید. نتایج حاصل از این پژوهش نشان دادند که استفاده همزمان از اطلاعات فنوتیپی، شجره ای و ژنوتیپی دو جمعیت برای برآورد صحت ارزش های اصلاحی ژنومی کاندیداهای انتخاب در جوامع کوچک در راهبرد سوم، علاوه بر افزایش صحت پیش بینی، تفاوت معنی داری در صحت پیش بینی را نسبت به دو راهبرد دیگر به همراه دارد.