efficiency of end-point pcr based detection of genetically modified organisms (gmos) in food and feed

Since the commercialization of transgenic crops in 1996, the biotech crop planted area has continuously increased. the european consumers have particularly been sceptical about transgenes in food products and eu (european union) has enacted very complex legislation. the area of food analytics requires continuous development and improvement of detection methods to track the legislative framework and respond to consumers requirements. in the last decade, real-time pcr (polymerase chain reaction) based methods have been the methods of choice for numerous laboratories, but for various reasons, end- point pcr based methods have still been used. in our research, 73 samples of food and feed were analysed for the presence of common elements of transgene construct – cauliflower mosaic virus 35s promoter (p-35s) and agrobacterium tumefaciens nopaline synthase terminator (t-nos), using end-point pcr based methods. these samples had been previously tested for the presence of the same elements using validated real-time pcr based methods. comparison of the used methods sensitivity showed that real-time pcr based methods have undeniable advantage. more important factor is specificity, and the fact that the list of approved genetically modified organisms (gmos) is constantly increasing necessitates updating of validation methods procedures. considering upward trend of approved gmos, it is important to pay more attention to the improvement and specialization of gmo detection methods.

کارآیی تشخیص ارگانیسم های تغییر ژنتیکی یافته (GMO) مبتنی بر End-Point PCR در مواد غذایی و علوفه ای

از زمان تجارتی شدن گیاهان تراریخته در 1996، مساحت زیر کشت گیاهان بیوتک (زیستتکنیک ) به طور پیوسته ای در حال گسترش است. مصرف کنندگان اروپایی به طور مشخصی در مورد ژن های ترازیخت در محصولات غذایی مشکوک بوده اند و اتحادیه اروپا (EU) در این باره مقررات بسیار پیچیده ای به کار بسته است. انجام تجزیه و تحلیل مواد غذایی نیازمند توسعه و بهبود روش های تشخیص برای ردیابی در چارچوب قانونی و پاسخ دادن به نیازهای مصرف کنندگان است. در دهه گذشته، روشهای مبتنی بر realtime PCR (واکنش زنجیره ای پلیمراز) روش انتخابی برای بسیاری از آزمایشگاه ها بوده است، ولی به دلیل های مختلف، روش های مبتنی بر EndPoint PCR همچنان مورد استفاده قرار می گیرند. در این پژوهش، 73 نمونه مواد غذایی و علوفه ای برای تعیین حضور اجزای معمولی ساختار ژن های تراریخته Cauliflower Mosaic Virus 35S promoter (P35S) و Agrobacterium tumefaciens Nopaline Synthase Terminator (TNOS) با استفاده از روش های مبتنی بر EndPoint PCR مورد تجزیه قرار داده شد. این نمونه ها قبلا با روش تایید شده مبتنی بر realtime PCR برای تشخیص همان اجزای ژن های تراریخته مورد آزمون قرار گرفته بودند. مقایسه حساسیت روش های مزبور نشان داد که روش های مبتنی بر realtime PCR ارجحیتی انکار نشدنی دارند. عامل مهمتر در این موارد اختصاصی بودن (specificity) است و نیز این واقعیت که فهرست تایید شده ارگانیسم های تغییر ژنتیکی یافته (GMO) به طور پیوسته در حال افزایش است چنین ایجاب می کند که دستورالعمل روش های تشخیص به روز باشد. با در نظر گرفتن روند افزایشی GMO ، مهم است که به بهبود و تخصصی کردن روشهای تشخیص GMO توجه بیشتری معطوف شود.