|
|
|
|
diversity and population structure analysis of faba bean (vicia faba l.) accessions using ssr markers
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
tahir n. a. ,omar d. a. ,lateef d. d. ,ahmad d. a. ,salih s. h. ,hiwa khal l.
|
|
منبع
|
journal of agricultural science and technology - 2019 - دوره : 21 - شماره : 2 - صفحه:463 -474
|
|
چکیده
|
The awareness and conception of the genetic diversity in faba bean (vicia faba) accessions are important for the enforcement of degree addressed to their usages and conservations. the aim of this work was to estimate the genetic diversity and population structure in iraqi faba bean using ssr markers for utilization in crossing and variety development. to assess genetic variation and population structure among faba bean accessions, 25 microsatellite loci were exerted. the analysis of diversity indices in the set of faba bean accessions examined here showed that the microsatellites were informative for genotype characterization. in total, 72 polymorphic alleles were exposed to an average of 2.88 per locus and three unique alleles were detected. the average of pic, gene diversity, marker index, resolving power and shannon diversity was 0.513, 0.569, 1.671, 2.173 and 0.830, respectively. the patterns detected in the dendrogram and pca divided 19 accessions into five distinct clusters with different levels of subgrouping within the cluster. highlevel genetic differentiation within a population or group (83%) was significantly greater than that among groups or populations (17%), as planned by analysis of molecular variance (amova). the model of clustering, based on the analysis of structure software, identified four groups genetically dispersed. these findings have additional importance in faba bean breeding as well as maintenance programs.
|
|
کلیدواژه
|
genetic variation indices ,genetic structure ,legume ,microsatellites.
|
|
آدرس
|
university of sulaimani, college of agricultural sciences, department of horticulture, iraq, ministry of agriculture, general directorate of agriculture, iraq, university of sulaimani, college of agricultural sciences, department of field crops, iraq, university of sulaimani, college of agricultural sciences, department of field crops, iraq, university of sulaimani, college of agricultural sciences, department of field crops, iraq, university of sulaimani, college of agricultural sciences, department of horticulture, iraq
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
تجزیه تحلیل تنوع و ساختار جمعیتی لوبیای فابا (Vicia faba L.) با استفاده از نشانگر های SSR
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
Abstract
|
آگاهی و درک مفهوم تنوع ژنتیکی نمونه های ثبت شده لوبیای فابا (Vicia faba) برای اعمال درجه بندی در مصرف و حفاظت آنها مهم است. هدف این پژوهش تخمین تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی لوبیای فابا درعراق با استفاده از نشانگر های SSR برای کاربرد در تلاقی و تولید ارقام بود. به منظور ارزیابی تغییرات ژنتیکی و ساختار جمعیتی در میان نمونه های ثبت شده لوبیای فابا، 25 مکان ژنی ریزماهواره اعمال شد. تجزیه شاخص های تنوع در مجموعه لوبیا فابا های بررسی شده در این مطالعه نشان داد که ریز ماهواره ها برای مشخص کردن ژنوتیپ ها مفید و آموزنده بودند. در کل، 72 آلل پلیمورفیک به طور میانگین در معرض 88/2 مکان ژنی قرار داده شد و 3 آلل منحصر به فرد تشخیص داده شد. میانگین PIC، تنوع ژنتیکی، شاخص نشانگر،resolving power ، و تنوع شانون، به ترتیب برابر بود با 513/0، 569/0، 671/1، 173/2، و 83/0. الگوهای شناسایی شده در دندروگرام و تجزیه به مولفه های اصلی(PCA)، 19 نمونه ثبت شده را به 5 خوشه متمایز دسته بندی کرد که هر خوشه زیرگروه بندی متفاوتی داشت. همان گونه که طبق تجزیه واریانس ملکولی (AMOVA) برنامه ریزی شده بود، تمایز ژنتیکی در سطح بالا در درون یک جامعه یا گروه (83%) به طور معناداری بیشتر از تمایز بین گروه ها یا جامعه ها (17%) بود. مدل خوشه بندی بر مبنای تجزیه نرم افزار STRUCTURE، چهار گروه را که از نظر ژنتیکی پراکنده بودند شناسایی کرد.این یافته ها در برنامه های بهنژادی و نگهداری لوبیای فابا مورد استفاده دارند.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|