|
|
|
|
differential expression profiles of tomato mirnas induced by tobacco mosaic virus
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
abdelkhalek a. ,sanan-mishra n.
|
|
منبع
|
journal of agricultural science and technology - 2019 - دوره : 21 - شماره : 2 - صفحه:475 -485
|
|
چکیده
|
Plant micrornas (mirnas) play important roles in plant development and responses to biotic and abiotic stress. recently, there is clear evidence that mirnas are involved in hostvirus interactions. by using stemloop rtpcr, an expression levels change of thirteen mirna belonging to six mirna families targeting leaf development and morphogenesis were analyzed upon tobacco mosaic virus (tmv)tomato infection. compared to mock plants, significant changes in relative expression levels of nine mirnas were observed. the mir319c5p showed the highest statistically significant increase in accumulation at 15 days postinoculation. at all time points tested, mir159, mir164a3p, mir164a5p, mir166c5p and mir319c5p were upregulated while mir160, mir319a, mir319b, mir319c3p were downregulated in most cases. our data could provide new insights into the role of mirnas in tomatotmv interaction and in developing efficient strategies for improving tomato resistance against viral infection.
|
|
کلیدواژه
|
host-virus interaction ,stem-loop ,rt-pcr ,tmv ,viral infection.
|
|
آدرس
|
arid lands cultivation research institute (alcri), plant protection and bimolecular diagnosis department, egypt. international center for genetic engineering and biotechnology, aruna asaf ali marg, plant rnai biology group, india, international center for genetic engineering and biotechnology, aruna asaf ali mar, plant rnai biology group, india
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
پروفایل های بیانی تفکیکی مربوط به میکرو آر.ان. ا (miRNAs ) القاشده به وسیله ویروس موزائیکی تنباکو
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
Abstract
|
میکرو آر.ان. ا (miRNA ) های گیاهی در رشد گیاه و واکنش آن به تنش های زنده و غیر زنده نقش مهمی دارند. اخیرا، شواهد روشنی به دست آمده که نشان میدهد miRNAs در تعامل بین میزبان و ویروس دخالت دارند. در این زمینه، در پی آلودگی گوجه فرنگی با ویروس موزائیکی تنباکو(TMV)، با استفاده از روش stemloop RTPCR، تغییر در سطح بیان (expression levels change ) سیزده miRNAs از 6 فامیل miRNAs که رشد و مورفوژنز برگ را هدف قرار میدهند بررسی شد. تغییرات در سطح بیان نسبی 9 میکرو آر.ان. ا (miRNAs ) در مقایسه با گیاهان شاهد (mock plants) معنادار بود. 15 روز بعد از آلوده شدن، miR319c5p بیشترین افزایش درانباشت (accumulation) را نشان داد که از نظر آماری معنادار بود . در همه زمان های اندازه گیری، miR159، miR164a3p، miR164a5p، miR166c5p ، وmiR319c5p فراتنظیم شده ( upregulated ) بودند در حالیکه miR160، miR319a، miR319b، و miR319c3p در بیشتر موارد فروتنظیم شده(downregulated ) بودند. داده های این آزمایش نگرش جدیدی در مورد نقش miRNAs در تعامل بین گوجه فرنگی و TMV و نیز برای توسعه راهبردهای کارآمد در زمینه بهبود مقاومت گوجه فرنگی در برابر آلودگی ویروسی فراهم می کند.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|