آنالیز فیلوژنتیک ژن C 3 ویروس تب برفکی جداشده در ایران در سال 1389

در این مطالعه ابتدا توالی نوکلیوتیدی و اسید آمینه ژن c 3 ویروس تب برفکی سروتیپ o ایران جدا شده در سال 1389 تعیین و سپس با توالی ژن c 3 دیگر سویه‌های سروتیپ o، a، asia1 و c این ویروس که در بانک ژن ثبت شده‌اند، مقایسه گردید. بیشترین میزان شباهت‌ توالی نوکلیوتیدی با دو سویه سروتیپ a هندوستان شاملaind288/07 و aind360/00 به ترتیب با 74/93 و 58/93 درصد و سویه سروتیپ o ایران (irn 303-1) با 11/93 درصد مشاهده شد، در حالی که کم‌ترین میزان شباهت با سویه‌های سروتیپ a) gam/5/98/a) و(o (bkf/2/92/o غرب آفریقا به ترتیب با 01/87 و 11/88 درصد مشاهده گردید. بررسی توالی اسیدهای آمینه نیز نشان داد که ژن c 3 مورد مطالعه دارای بیشترین شباهت با سویه سروتیپ a هندوستان (ind 287/96) با 100 درصد و سپس با سویه سروتیپ o ایران (irn 303-1) با 56/99 درصد بود و کم‌ترین شباهت را با سویه سروتیپ a غرب آفریقا (gam/5/98/a) با 96/92 درصد داشت. بررسی‌های فیلوژنتیک نشان داد که دو سویه‌ ایرانی (iran/1/2010 و irn 303-1) در یک خوشه با سویه‌های سروتیپ a هندوستان قرار گرفتند، هرچند که دو سویه جدا شده از ایران در نهایت در دو شاخه مجزا از هم جدا شدند. همه سویه‌های مربوط به یک سروتیپ خاص در خوشه‌های مختلف قرار گرفته و یک خوشه مجزا برای یک سروتیپ خاص مشاهده نشده است. بنابراین احتمالاً این ژن بین سرتیپ‌های مختلف محافظت شده بوده و تغییرات ممکن است ناشی از نوترکیبی تصادفی در بین سروتیپ‌ها باشد. توالی ژن c 3 سروتیپ o شیوع یافته در ایران در سال 1389 در بانک ژن با شماره hq663880 ثبت گردید.