بررسی همگنی ساختار ژنتیکی در جمعیت گوسفند نژاد زندی با استفاده از داده‌های ژنومی

داده‌های ژنومی می‌تواند ما را به چگونگی شکل‌گیری نژادها و جمعیت‌ها و روند تاثیرگذاری رخدادهای ژنتیکی هرچند کمیاب در گذر زمان رهنمون سازد. از موارد بسیار ارزشمند جهت حفظ ذخایر ژنتیکی که خود موضوعی پر اهمیت تلقی می‌گردد و همچنین بهبود برنامه‌های اصلاح نژادی، پی‌بردن به ساختار ژنتیکی جوامع مورد مطالعه است. جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند زندی واقع در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند زندی تهران از روش آنالیز تفکیکی مولفه‌های اصلی (dapc) و همچنین از آنالیز مولفه‌های اصلی (pca) استفاده شد .پس از99 راس گوسفند نژاد زندی خونگیری و تعیین ژنوتیپ با تراشه‌های اسنیپ k50 شرکت ایلومینا صورت گرفت. روش تجزیه‌ی تفکیکی مولفه‌های اصلی، به وضوح ساختار ژنتیکی جمعیت مورد مطالعه و تفکیک حیوانات را در دو گروه نشان داد که می‌تواند ناشی از حساسیت روش dapc باشد که قادر به بررسی همگنی واریانس در جوامع حیوانی است. در روش dapc، برای ارزیابی تعداد بهینه‌ی خوشه با معیار bic، 2=k بهترین نتیجه را نشان داد. بررسی نتایج حاصل جهت حفظ تعداد مولفه‌ی اصلی برای آنالیز تفکیکی، 31 مولفه‌ی اول را تعداد بهینه‌ی مولفه‌ برای مراحل بعدی آنالیز در نظر گرفت. با توجه به اهمیت در نظر گرفتن واریانس درون گروهی و همچنین ساختار ژنتیکی جوامع جهت آنالیزهای مهم ژنومی مشخص شد که روش dapc در مطالعه‌ی ساختار ژنتیکی گوسفند زندی به دلیل در نظر گرفتن تعداد مولفهی بیشتر و متعاقباً افزایش واریانس در نظر گرفته شده نسبت به روش pca کاراتر می باشد.