ارتباط چندشکلی‌های ژن fasn با صفات تولیدی و تولیدمثلی در گاوهای هلشتاین استان کرمان

اسید چرب سنتتاز (fasn)، یک پروتئین چندعاملی است که سنتز اسیدهای چرب را انجام می‌دهد، توسط ژن fasn رمزگذاری می‌شود و یکی از ژن‌های کاندیدای عمده شناخته شده است که نقش اصلی در بازسازی سنتز چربی‌ها در پستانداران ایفا می‌کند. این مطالعه به منظور شناسایی چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی ژن fasn و کاوش ارتباط آنها با سه صفت اقتصادی مهم شامل تولید شیر (m)، فاصله گوساله‌زایی (ci) و نرخ آبستنی (cr) در گاوهای هلشتاین استان کرمان انجام شد. نمونه‌های خون کامل مربوط به 38 راس گاو شیری هلشتاین با ارزش‌های اصلاحی برآورد شده بالا و پایین جمع‌آوری شد. dna ژنومی از نمونه‌های خون گاو با استفاده از کیت استخراج dna ژنومی بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده استخراج شد. مواد ژنتیکی برای تکثیر قطعه ژن انتخابی (به طول 750 جفت باز از اگزون 37 تا 39) با واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز استفاده شد. متعاقباً تمام قطعات تکثیری مستقیماً برای توالی‌یابی استفاده شدند. در ادامه تجزیه توالی‌های هدف با رگرسیون چندگانه اثرات متوسط جایگزینی آللی بر صفات تولید شیر، فاصله گوساله‌زایی و نرخ آبستنی 58 نشانگر snp را نمایان ساخت که از بین آنها هشت snps به طور کلی با صفات تولیدی و تولید مثلی مرتبط بودند. تولید شیر، فاصله گوساله‌زایی و نرخ آبستنی به ترتیب با سه (g.16593a>g, g.16670c>a, g.16776c>t)، سه (g.16524g,c,t>a, g.16830g,c,t>a, g.16833a,t>g) و دو (g.16594a,c>g and g.16811a,t>g) snps ارتباط معنی‌دار داشتند (05/0p<). ارتباط چند‌شکلی جایگاه ژن fasn با صفات می‌تواند به‌عنوان نشانگر مولکولی در تعیین شایستگی ژنتیکی دام‌ها و همچنین راهبردهای اصلاح نژادی در جمعیت گاوهای هلشتاین مورد استفاده قرار گیرد.

Association of polymorphisms of FASN gene with productive and reproductive traits in Iranian Holstein cows of Kerman province

Fatty acid synthase (FASN), a multifunctional protein that carries out the synthesis of fatty acids, is coded by FASN gene which is known as major candied gene and plays a central role in de novo lipogenesis in mammals. This study was conducted to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the FASN gene and explore their relationships with three economically important traits including milk production (M), calving interval (CI) and conception rate (CR) in Holstein cows of Kerman province. The whole blood samples corresponding to the 38 Holstein cows with high and low estimate breeding values were collected. Genomic DNA was extracted from blood samples of the cows using a genomic DNA kit according to the manufacturer’s instructions. The genetic material was used for polymerase chain reaction amplification of selected gene fragments (750bp length from exon 37 to 39). All of PCR products were subsequently used directly for sequencing. Analysis of the target sequence followed by multiple regression of average allele substitution effects on M, CI, and CR traits revealed 58 SNP markers, among which 8 SNPs were totally associated with productive and reproductive traits. (M), (CI) and (CR) were affected by three (g.16593A>G, g.16670C>A and g.16776C>T), three (g.16524G,C,T>A, g.16830G,C,T>A, g.16833A,T>G) and two (g.16594A,C>G and g.16811A,T>G) SNPs respectively (P<0.05). Association between polymorphism in FASN gene and traits could be used as molecular markers for determination of animal’s genetic potential as well as breeding strategies in Holstein population.