|
|
مقایسه رویکرد حداکثر درست نمایی محدود شده با بیزی در برآورد اجزای واریانس ژنومی صفات پشم گوسفند مرینوس
|
|
|
|
|
نویسنده
|
راشدی ده صحرائی آذر ,فیاضی جمال ,عبداللهی آرپناهی رستم ,ون در ورف جولیوس ,روشنفکر هدایت الله
|
منبع
|
علوم دامي - 1397 - شماره : 120 - صفحه:35 -46
|
چکیده
|
برآورد دقیق اجزای واریانس ژنتیکی و غیرژنتیکی با اطلاعات شجرهای و ژنومی، از ملزومات پیشبینی صحیح ارزشهای اصلاحی میباشد. از آنجایی که تراشههای چندشکلی تکنوکلئوتیدی (snp) کل ژنوم را پوشش میدهند، نشانگرها تمامی جایگاههای صفات کمی را تحت پوشش قرار داده و به طور بالقوه تمام واریانس ژنتیکی را توجیه میکنند. در این پژوهش از snpهای گوسفندان مرینوس استرالیایی استفاده شد. صفات طول و قطر تار پشم مورد بررسی قرار گرفتند. برای مطالعه رابطه بین فراوانی آللی و مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده، snpها در پنج گروه مختلف از فراوانی آللی کمیاب (maf)، طبقه بندی شدند. دو مدل آماری با آنالیز مجزای هر گروه snp و آنالیز توام هر پنج گروه snp برازش شدند. آنالیزهای آماری با دو روش حداکثر درستنمایی محدود شده ژنومی (روش پارامتری) و بیزی (با استفاده از تکنیک نمونهگیری گیبس و مدل rkhs (روش نیمهپارامتری)) انجام شد. مقدار وراثتپذیری ژنومی برآورد شده توسط همه snpها در رویکرد reml، برای قطر و طول تار پشم به ترتیب برابر 0.72 و 0.48 بود. در رویکرد بیزی این مقدار وراثتپذیری برای صفات مذکور به ترتیب برابر 0.74 و 0.47 برآورد گردید. در تجزیه و تحلیل مجزای گروههای مختلف maf مقادیر وراثتپذیری ژنومی هر دو رویکرد مشابه ولی در تجزیه توام، بین دو رویکرد تفاوت زیادی وجود داشت. بطور کلی در مدلهای ساده نتایج دو رویکرد مشابه بوده ولی در مدلهای پیچیده مانند آنالیز توام نتایج دو مدل متفاوت و معنیدار هستند. برای بررسی اینکه کدام روش از اعتبار بالاتری برخوردار است نیاز به تحقیقات آتی میباشد.
|
کلیدواژه
|
گوسفند مرینوس، واریانس ژنومی، روش پارامتری، روش بیزی، انتخاب ژنومی
|
آدرس
|
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان, ایران, دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان, ایران, دانشگاه تهران، پردیس ابوریحان, ایران, دانشگاه نیوانگلند, دانشکده کشاورزی و علوم روستائی, استرالیا, دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Comparison of restricted maximum likelihood and Bayesian approaches in estimation of genomic variance components of wool traits in Merino sheep
|
|
|
Authors
|
Rashedi Dehsahraei Azar ,fayazi Jamal ,Abdollahi-Arpanahi Rostam ,Van Der Werf Julius ,Roshanfekr Hedayatollah
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|