جداسازی و بررسی خاصیت ضدباکتریایی اکتینوباکتریا از کود الاغ

فراورده‌های میکروبی نقش مهمی در هضم و جذب مواد، افزایش ایمنی و مقاومت در برابر بیماری‌ها دارند. این فراورده‌ها به وفور به وسیله اکتینوباکتریا تولید می‌گردند. پژوهش حاضر با هدف جداسازی اکتینوباکتریا، بررسی اولیه خاصیت ضد‌باکتریایی و شناسایی ژن‌های مولد ترکیبات فعال زیستی از کود الاغ انجام گرفت. برای این منظور نمونه‌های کود الاغ بر روی محیط استارچ کازئین کشت داده شدند، سپس جدایه‌های اکتینوباکتریا با استفاده از روش مولکولی pcr شناسایی شده و خاصیت ضد باکتریایی آن‌ها با استفاده از روش انتشار از چاهک در آگار بررسی شد. همچنین، این جدایه‌ها به منظور غربالگری ژن‌های pks i ،pks ii و nrps مورد بررسی قرار گرفتند. از 92 جدایه اکتینوباکتریایی، 66 جدایه دارای فعالیت آنتاگونیستی در برابر باکتری‌های تست بودند. از این تعداد، 61 جدایه (92 درصد) استافیلوکوکوس اورئوس، 45 جدایه (68 درصد) اشریشیا کلی، 47 جدایه (71 درصد) باسیلوس سرئوس و چهار جدایه (6 درصد) سودوموناس اروجینوزا را مهار رشد کردند. نتایج حاصل از آنالیز مولکولی ژن‌های pks i و pks ii و nrps برای 30 جدایه اکتینوباکتریایی انتخاب شده از میان 92 جدایه مذکور نشان داد که 18 جدایه (54 درصد) حاوی ژن nrps، هفت جدایه (23 درصد) حاوی ژن pks i و نه جدایه (30 درصد) حاوی ژن pks ii بودند. نتایج این پژوهش بیانگر غنی بودن کود الاغ از اکتینوباکتریای تولید‌کننده ترکیبات فعال زیستی با خاصیت ضد‌باکتریایی و حاوی درصد قابل توجه از ژن‌های pks i،   pks ii و nrps است.

Isolation and evaluation of antibacterial activity of Actinobacteria from donkey manure

Microbial products play an important role in digestion and absorption of substances, increase immunity and disease resistance. These products are abundantly produced by Actinobacteria. The aim of this study was to isolate Actinobacteria, to investigate the antibacterial properties and to identify the genes that produce bioactive compounds from donkey manure. For this purpose, donkey manure samples were cultured on the casein stretch medium, then Actinobacteria isolates were identified by PCR and their antibacterial properties were investigated by agar well diffusion method. These isolates were also screened for PKS I, PKS II and NRPS genes. Of 92 Actinobacterial isolates, 66 isolates had antagonistic activity against test bacteria. Of these, 61 isolates (92%) inhibited Staphylococcus aureus, 45 isolates (68%) Escherichia coli, 47 isolates (71%) Bacillus cereus and four isolates (6%) inhibited Pseudomonas aeruginosa. The results of molecular analysis of PKS I, PKS II and NRPS genes for 30 isolates of Actinobacteria selected from the 92 isolates showed that 18 isolates (54%) contained NRPS gene, seven isolates (23%) enclosed PKS I gene and nine isolates (30%) contained PKS II gene. The results of this study indicate that donkey manure is rich in Actinobacteria producing bioactive compounds with antibacterial properties and contain a significant percentage of PKS I, PKS II and NRPS genes.