|
|
بررسی فیلوژنی ملکولی عقرب همی اسکورپیوس لپتوروس استان خوزستان براساس توالی dna ریبوزومی در ناحیه internal transcribed spacers 2 (its2)2
|
|
|
|
|
نویسنده
|
چهاری کبری ,جلودار عباس ,جعفری هدیه
|
منبع
|
تحقيقات دامپزشكي و فرآورده هاي بيولوژيك - 1399 - شماره : 129 - صفحه:112 -122
|
چکیده
|
عقربزدگی یکی از مشکلات جدی برای بهداشت عمومی بویژه در استان خوزستان است. عقربهای جنس hemiscorpius به عنوان یک عامل مهم در زمینه عقربزدگی و مرگ و میر ناشی از آن بویژه در کودکان مطرح است. یازده نمونه عقرب hemiscorpius lepturus از 6 منطقه استان خوزستان صید و پس از شناسایی، استخراج ژنومیک dna به روش دستی فنل/کلروفرم انجام گرفت. به کمک واکنش زنجیرهای پلیمراز، ژن (internal transcribed spacer 2 (its2 با اندازه حدودا 350 نوکلئوتید با استفاده از آغازگرهای رفت و برگشت افزودهسازی و سپس توالی یابی گردید. توالیهای نوکلئوتیدی بهدستآمده با استفاده از برنامه nblast موجود در پایگاه اینترنتی ncbi در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی نشان داد که درخت فیلوژنی ترسیم شده دارای دو خوشه اصلی a و b است، که با میزان همبستگی 85 درصدی از یکدیگر جدا شدند. خوشهی a به سه زیر خوشهی a1 (شامل: h8 ,h9h11m ,h5 ,h44 ,h2 و h10) a2 (شامل: h22 و h4) و a3 (شامل: h10m) قابل تقسیم است، که نمونههای موجود در این زیر خوشهها با هم همبستگی بین 85-54% را نشان دادند. توالیهای مورد مطالعه مشابهت نزدیکی (98.6-81.7%) با تنها توالی عقرب (hemiscorpius lepturus(ku341981 ثبت شده در پایگاه بانک ژن بهمراه تعدادی از عقربهای خانواده hemiscorpiidae نشان دادند. تنها نمونه عقرب h9m در خوشه b با فاصله ژنتیکی نسبتا بالایی (19.1-11.7%) متمایز از بقیه نمونهها قرار گرفت، که این یافته احتمالا بیانگر وجود زیر گونهای متفاوت از عقرب hemiscorpius lepturus استان خوزستان میباشد.
|
کلیدواژه
|
فیلوژنتیک، عقرب، hemiscorpius lepturus، internal transcribed spacers (its2)
|
آدرس
|
دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده دامپزشکی, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده دامپزشکی, گروه علوم پایه, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ایران, موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، شعبه اهواز, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
molecular phylogeny of scorpion hemiscorpius lepturus based on sequences ribosomal dna in the internal transcribed spacers (its2) in khuzestan province
|
|
|
Authors
|
chehari k. ,jolodar a. ,jafari h.
|
Abstract
|
scorpion sting is one of the serious problems for public health especially in khuzestan province. the genus hemiscorpius scorpions are a major factor to scorpion sting and its related death particularly in children. eleven specimens of hemiscorpius lepturus scorpion were collected from 6 regions of khuzestan province and after identification, genomic dna extraction was performed by manual method of phenol / chloroform. the internal transcribed spacers (its2) genes with about 350 nucleotides was amplified by pcr and then sequenced using forward and reverse primers. the nucleotide sequence was compared using the nblast program available at ncbi web site genbank database. the results of the phylogenetic showed that the samples can be identified in two clusters a and b, with 85% correlation. cluster a is subdivided into three subclusters a1 (including: h8, h9, h11m, h5, h44, h2 and h10), a2 (h22 and h4), and a3 (h10m). the specimens in these subclusters, showed a correlation between 5485%. the studied sequences showed similarity (81.798.6%) with the only hemiscorpius lepturus scorpion sequence (ku341981) recorded at the genbank database beside a number of scorpions of the hemiscorpionidae family. the only h9m scorpion specimen in cluster b with a relatively high genetic distance (11.7–19.1%) was discriminated from the rest of the specimens, indicating that this specimen probably belongs to a subspecies different from the hemiscorpius lepturus scorpion of khuzestan province.
|
Keywords
|
hemiscorpius lepturus ,(internal transcribed spacer 2 (its2
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|