بررسی تاثیر pH بر جهش در ژن P53 با استفاده از روش های محاسباتی و مدل سازی

سابقه و هدف: ژن سرکوبگر تومور p53 که به عنوان محافظ ژنوم شناخته می شود، در بیشتر از نیمی از تمام انواع سرطان-های انسانی جهش یافته است. پروتیین p53 یک عامل رونویسی است که وظیفه آن کنترل رونویسی از ژن های مسیول آپپتوز و توقف چرخه سلولی است. هم چنین پروتیین p53 می تواند رونویسی از ژن هایی که در پیشرفت چرخه سلولی نقش دارند جلوگیری نماید. بنابراین بدیهی است که از دست دادن فعالیت این ژن با فراوانی بالا در انواع مختلفی از سرطان ها مشاهده شده است. مشاهدات تجربی هم زمانی بین افزایش اسیدیته و نیز جهش در کدون های خاص ژن p53 (به طور خاص کدون 248) را نشان داده اند. این امر می تواند تا حدود زیادی ناشی از پروتونه شدن این توالی سه نوکلیوتیدی باشد. جهش در این کدون خاص باعث جایگزینی اسید آمینه می گردد که نتیجه آن ایجاد پروتیینی با خاصیت انکوژنی می باشد. در این مطالعه تاثیر ph اسیدی را بر پایداری کدون 248 در ژن p53 بررسی گردید. مواد و روش ها: در این مطالعه از روش مکانیک مولکولی برای پاسخ پرسش این مطالعه استفاده شد. در این مطالعه از نرم-افزار hyperchem استفاده شد. هم چنین به منظور دست یافتن به بهترین پیش بینی از میدان های نیروی amber، bio+، mm+ و opls استفاده گردید.یافته ها: نتایج به دست آمده در میدان های نیروی مختلف همگی نشان دادند که در phاسیدی سطح انرژی توالی مورد بررسی به میزان زیادی بالاتر از شرایط فیزیولوژیک می باشد.نتیجه گیری: نتایج این مطالعه پاسخ قابل ملاحظه ای را درباره هدف مطرح شده ارایه نمود و نشان داد کهph اسیدی می تواند به لحاظ تیوریک ناپایداری مولکول را نسبت به ph فیزیولوژیک افزایش دهد.