|
|
|
|
مطالعه فیلوژنتیکی و فیزیکوشیمیایی ژن SOS1 در گونه های مختلف گیاهی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
فاطمی سیده فرزانه ,نجفی زرینی حمید ,حیدری پرویز
|
|
منبع
|
تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي-مولكولي - 1393 - دوره : 5 - شماره : 17 - صفحه:8 -12
|
|
چکیده
|
سابقه و هدف: سیستم های sos مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه tair، ebi، ncbi، plantcare وexpasy و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افزارهای mega5، bioedit و upgma تعیین گردید. یافته ها: بر مبنای نتایج تجزیه کلاستر، توالی پروتیینی این ژن در سه گروه قرار گرفت. نتایج ماتریس تکاملی نشان داد بیشترین فاصله بین آرابیدوپسیس و آجیلوپس توچی و کم ترین فاصله بین گندم نان و آجیلوپس توچی وجود داشت. نتایج هم ردیف نمودن توالی پروتیینی نشان داد که توالی ژن sos1 در این گیاهان، در 15 اسید آمینه کاملاً مشابه است.بحث: وجود ناحیه abre که در پاسخ به اسید آبسزیک فعال می شود و هم چنین جعبه caat که یک ناحیه جهت افزایش بیان ژن می باشد در همه نواحی پروموتوری گیاهان مورد مطالعه، حاکی از پتانسیل گیاهان حاوی ژن (sos1) جهت مقابله با تنش های غیر زیستی می باشد.نتیجه گیری: تشابه 15 اسید آمینه در توالی پروتیینی در این گیاهان بیانگر ناحیه حفاظت شده در طی فرایند تکامل است و می تواند دارای نقش ساختاری مهمی در عملکرد پروتیین داشته باشد و توالی نوکلیوتیدی آن جهت طراحی پرایمر نیز پیشنهاد گردد.
|
|
کلیدواژه
|
شوری ,sos1 ,آنالیز فیلوژنتیکی ,تجزیه کلاستر ,salinity ,phylogenetic analysis ,cluster analysis
|
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|