تجزیه ارتباطی صفات زراعی با نشانگرهای ریز ماهواره (ssr) در ژنوتیپ های مختلف برنج در شرایط غرقاب و کم آبیاری

امکان بررسی اولیه ژن‌های کنترل‌کننده صفات کمی توسط روش تجزیه ارتباطی وجود دارد. در این پژوهش ارتباط بین صفات زراعی و نشانگر‌های مولکولی در برنج با استفاده از 21 صفت زراعی و 189 مکان ژنی حاصل از 36 جفت نشانگر ریزماهواره بر روی 59 ژنوتیپ برنج در شرایط غرقاب و تنش خشکی مورد مطالعه قرار گرفت. محتوای اصلاعات چند شکل (pic) با میانگین 0.58 برآورد شد که نشانگر rm6022 با 0.32 کمترین چندشکلی و rm5647 با 0.81 بیشترین چندشکلی را نشان دادند. نتایج حاصل از تجزیه رگرسیون گام به گام برای صفات مرفولوژیکی نشان داد 90 نشانگر در شرایط نرمال و در شرایط تنش خشکی 69 نشانگر شناسایی شد. اکثر نشانگرهای مثبت در شرایط نرمال برای تعداد خوشه و تعداد روز تا گلدهی با 9 نشانگر و در شرایط تنش خشکی وزن خوشه با 9 نشانگر مشاهده شد. بیشترین توجیه تغییرات در شرایط نرمال مربوط به صفت تعداد دانه کل خوشه (0.83) توسط مکان‌های ژنی rm6324-e، rm5652-e، rm6179-f، rm549-b، rm5761-d، rm7420-d و rm462-b تبیین شد. در شرایط تنش خشکی بیشترین توجیه تغییرات مربوط به صفت وزن خوشه (0.70) توسط مکان‌های ژنی rm7118-g، rm3525-b، rm5761-b، rm519-d، rm7545-a، rm38-c، rm7091-a، rm5647-b و rm6179-e تبیین شد. نتایج نشان دهنده ارتباط برخی از نشانگرها با بیش از یک صفت است که خود نشان دهنده پیوستگی نزدیک این صفات با یکدیگر است که احتمالا تحت تاثیر ژن‌های چند اثره قرار دارند. تهیه نسل‌های در حال تفرق و نقشه‌های پیوستگی برای درک این موضوع ضروری می‌باشد.

association analysis of agronomic traits using microsatellite markers (ssr) in different rice genotypes in terms of flooding and drought

introductionrice is an important crop that is considered a staple meal for 2.7 billion people worldwide. therefore, the demand for it will increase with the increase of population. environmental constraints always pose a serious threat to crop production, including rice. drought is one of the most important challenges that limits the production of high-yielding cultivars in arid and rainfed areas. global warming has also become a factor in limiting rice production in rain-dependent areas. therefore, researchers are looking for a way to stabilize rice production in arid regions. in this study, informative markers related to the desired agronomic traits were identified in 59 rice genotypes using microsatellite marking system.materials and methodsin order to evaluate the tolerance of rice genotypes to drought stress and to identify tolerant and sensitive genotypes, 59 genotypes received from the national rice research institute and the international rice research institute in a randomized complete block design with three replications in two separate conditions, without stress (flood) and drought stress were performed in a research farm located in aliabad katoul city in 2013. in both conditions (normal and drought stress), the genotypes were planted in five rows of 25 × 25 cm in rows one meter long. thirty days after planting in the nursery, healthy and strong seedlings were transferred to the main land. the required agronomic operations were carried out equally during the growth and development period of the plants under stress and normal conditions and only in terms of irrigation of the experimental field in both flood and stress environments, until the tillering stage of the cultivars were equally flooded. then, to create stress, irrigation was done from 40 days after transplanting (maximum tillering stage) to the end of the growing season at 25-day intervals. phenotypic values of grain yield and 1000-grain weight were measured under two conditions according to standard guidelines for evaluation of traits in rice. in order to investigate the relationship between agronomic traits and microsatellite markers with 59 rice genotypes out of 36 microsatellite molecular markers were performed in the plant breeding and genetics laboratory of gonbad kavous university, faculty of agriculture and natural resources.