بررسی تنوع ژنتیکی ماهی حلوا سیاه (parastromateus niger) و سوکلا (rachycentron canadum) در خلیج فارس با استفاده از توالی یابی ژن 16srrna

مقدمه: شناسایی ملکولی گونه های اقتصادی خلیج فارس جهت حفاظت از منابع گونه های اندمیک و معرفی گونه های جدید امری ضروری است. این پژوهش با هدف آگاهی از تنوع ژنتیکی و فاصله ژنتیکی دو گونه سوکلا و حلوا سیاه در خلیج فارس در مقایسه با نمونه های دیگر از نقاط نزدیک مانند اقیانوس هند و دور مانند اقیانوس آرام انجام گرفت.مواد و روش ها: 120 نمونه از هر کدام از آب های دو منطقه بندر ماهشهر در استان خوزستان و بندرعباس در استان هرمزگان و با توجه به نقاط صید عمده گونه های مورد نظر به صورت تصادفی جمع آوری و پس از جدا نمودن دو گرم از بافت هر باله ماهیان و قرار دادن درون میکروتیوب های دو میلی لیتری حاوی اتانول به آزمایشگاه انتقال یافت. قسمتی از ژنوم mtdna به نام 16srrna با موفقیت تکثیر و تعیین توالی شد و حدود 560 جفت باز قابل اطمینان جهت بررسی فیلوژنی انتخاب گردیدند. نتایج: در نتیجه مقایسه توالی ها، توالی‌های نمونه‌های حلوا سیاه بندر عباس و بندر ماهشهر به همراه نمونه هایی از مناطق مالزی و ژاپن با مجموع پنج هاپلوتیپ خود را در یک کلاید یافت شد. گرچه نمونه ای از بندرعباس با اختلاف ژنتیکی بالا (0.072) خود را از بقیه نمونه ها جدا کرد. کلاید دوم در ارتباط با گونه سوکلا نیز به دو خوشه تقسیم شدند که نمونه های بندرعباس و خوزستان در قالب یک هاپلوتایپ یکسان در خوشه اول و نمونه های پهنه آبی پاکستان و امریکا در قالب دو هاپلوتیپ مجزا در خوشه دوم خود را نشان دادند. بحث و نتیجه گیری: در این پژوهش می توان نتیجه گرفت که صید بی رویه و احتمال از دست دادن آلل ها، افزایش میزان هم خونی در بین جمعیت های پرورشی، ورود احتمالی آن ها به دریا، وجود سدهای فیزیکی و نقاط خاص نوزادگاهی و در نتیجه تمایل کم تر یه مهاجرت، از عوامل مهم در پایین تر آمدن تنوع زنتیکی گونه های مورد مطالعه در منطقه خلیج فارس می باشد.

investigating of the genetic diversity of black halva fish (parastromateus niger) andsokla (rachycentron canadum) in the persian gu lf using 16srrna gene sequencing

introduction: molecular identification of the economic species of the persian gulf isnecessary to protect the resources of endemic species and to introduce new species. thisresearch was conducted with the aim of determining the genetic diversity and geneticdistance of two species of sokla and black halva in the persian gulf compared to othersamples from nearby locations such as the indian ocean and far away locations such as thepacific ocean.materials & methods: 120 samples from each of the waters of the two regions of bandarmahshahr in khuzestan province and bandar abbas in hormozgan province andcorresponding to the main fishing areas of the desired species were randomly collected andafter separating two grams of tissue from each fin. the fish were placed in two millilitermicrotubes with ethanol and transferred to the laboratory. a portion of the mtdna genomecalled 16srrna was successfully amplified and sequenced, and approximately 560 reliablebase pairs were selected for phylogeny analysis.results: as a result of comparing the sequences, the sequences of black halva specimensfrom bandar abbas and bandar mahshahr were found together with samples frommalaysia and japan with a total of five haplotypes in one clyde. however, one sample frombandar abbas differed from the rest of the samples with a high genetic difference (0.072).the second clyde was divided into two clusters with respect to sokla species, where withsamples from bandar abbas and khuzestan showing up as one haplotype in the first cluster,and samples from the blue zone of pakistan and america as two separate haplotypes in thesecond cluster.conclusion: in this research, it can be concluded that overfishing and the possibility of lossof alleles, increase in inbreeding between breeding populations, their possible entry into thesea, the presence of physical barriers and special nursery areas and as a result in a reducedtendency to migrate is one of the important factors for reducing the genetic diversity of thestudied species in the persian gulf region.