تنوع فیلوژنتیکی و ارتباط باکتری‌های رسوب، آب و ماهیان در رودخانه کارون (مطالعه موردی شهر اهواز)

مقدمه: باکتری‌ها فراوان‌ترین و غنی‌ترین گروه از موجودات هستند که در بسیاری از فرآیندهای مهم اکوسیستم نقش حیاتی دارند، از این رو در مطالعات مختلف تنوع آن ها مورد بررسی قرار گرفته است. این پژوهش، با هدف بررسی تنوع فیلوژنتیکی باکتری‌های رودخانه کارون و ارتباط آن با رسوب و ماهیان انجام گرفت.مواد و روش‌ها: این مطالعه در بهار 1401 و روی باکتری‌های نمونه‌های آب، رسوب و ماهیان کپورمعمولی ((cyprinus carpio، تیلاپیا (tilapia zilli) و برزم (barbus barbulus) 4 ایستگاه مربوط به رودخانه کارون در محدوده‌ شهر اهواز انجام شد. از روش کشت متوالی به منظور خالص‌سازی سویه‌ها استفاده شد. استخراج ژنی dna ژنومی با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام و ژن مربوط به زیر واحد ریبوزومی (16s rrna) تکثیر گردید. تحلیل فیلوژنتیک سویه‌ها پس از تعیین توالی‌های مشابه و همراستاسازی توالی‌ها، ویرایش و رسم درخت فیلوژنتیک با نرم‌افزار (v.11) mega انجام شد. نتایج: 50 سویه از 8 خانواده باکتری از آب، رسوبات و ماهیان جدا شد. سویه‌های متعلق به خانواده باسیلوس‌ها، بالاترین فراوانی را در آب، رسوب و ماهیان داشتند (0.05>p). هم چنین در تمام مناطق نمونه‌برداری تنوع باکتریایی در رسوب بیش تر از آب بود و ترکیب جامعه باکتریایی دستگاه گوارش ماهیان بیش تر شبیه رسوبات کناره‌های ساحل رودخانه بود. بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج مطالعه‌ حاضر و تاثیرپذیری باکتری‌های روده ماهی از رسوبات، شناخت فلور باکتریایی طبیعی اکوسیستم ماهی، می‌تواند در مدیریت اکوسیستم های آبی و استفاده از آن ها برای کاربری های مختلف موثر باشد. از طرفی با توجه به امکان شیوع عوامل بیماری‌زای غیربومی و یا مقاوم در برابر آنتی‌بیوتیک‌ها در اثر ورود فاضلاب انسانی به رودخانه، حفظ سلامت رودخانه و تصفیه فاضلاب قبل از ورود به رودخانه‌ کارون ضروری به نظر می‌رسد.

phylogenetic diversity and relationship between of sediment, water and fishbacterial in karoon river (case study: ahvaz city)

bacteria are the most abundant and richest group of organisms that play avital role in many important ecosystem processes; hence their diversity has been investigatedin various studies. this research was conducted with the aim of investigating thephylogenetic diversity of bacteria in the karoon river and its relationship with sediment andfish.materials & methods: this study was conducted in the spring of 2022 and on the bacteriaof water samples, sediment and cyprinus carpio, tilapia zilli and barbus barbulus of 4stations of the karoon river in ahvaz city. sequencing was used to purify the strains.genomic dna gene extraction was performed using general primers and the gene related tothe ribosomal subunit (16s rrna) was amplified. phylogenetic analysis of the strains afterdetermining the similar sequences and aligning the sequences, editing and drawing thephylogenetic tree with mega software (v.11) was performed.results: 50 strains of 8 bacterial families were isolated from water, sediments and fish. thestrains belonging to the bacillus family had the highest frequency in water, sediment andfish (p<0.05). also, in all the sampling areas, the bacterial diversity in the sediment wasmore than that of the water, and the composition of the bacterial community in the digestivesystem of fishes was more similar to the sediments on the riverside.conclusion: according to the results of the present study and the effectiveness of fish gutbacteria from sediments, knowing the natural bacterial flora of fish ecosystems can beeffective in managing aquatic ecosystems and using them for different uses. on the otherhand, due to the possibility of the spread of non-indigenous pathogens or resistant toantibiotics as a result of human sewage entering the river, it seems necessary to maintain thehealth of the river and purify the sewage before entering the karoon river.