بررسی Snpهای موجود در ژن های مرتبط با متابولیسم چربی و گلوکز در ژنوم شترهای تک‌کوهانه و دوکوهانه‌های اهلی و وحشی

هدف از تحقیق حاضر، شناسایی snpهای موجود در ژن های مرتبط با متابولیسم چربی و گلوکز در ژنوم شترهای تک‌کوهانه و دوکوهانه اهلی و وحشی بود. بدین منظور، ابتدا ژن های مهم مرتبط با متابولیسم چربی (15 ژن) و گلوکز (17 ژن) در پستانداران با استفاده از آنالیز ddd و هم چنین مرور مقالات معتبر شناسایی شد. به منظور اعتبار‌سنجی برای ژن های انتخاب شده، آنالیز هستی‌شناسی ژن روی آن ها اجرا شده و عبارات معنی دار مربوط به چربی و گلوکز مشاهده شد. در مرحله بعد، snpهای مشترک بین سه نفر شتر تک‌کوهانه (993474)، چهار نفر شتر دوکوهانه اهلی (1246741) و دو نفر شتر دوکوهانه وحشی (2586654) استخراج شده و snpهای موجود در ژن های مورد مطالعه در کل ژنوم سه گونه شتر، شناسایی و دسته‌بندی شدند. نتایج به دست آمده نشان داد که بیش ترین snpهای شناسایی شده، در نواحی اینترونی، بالادست و پایین دست ژن ها بوده و از انواع تغییر نوکلئوتید‌های تنظیمی به شمار می‌روند. برخی از ژن ها دارای الگوهای متفاوتی از نظر snpها در بین سه گونه بودند. به طوری که برخی ژن ها در برخی از گونه‌ها دارای تعدادی snp و در سایر گونه‌ها، بدون تغییر نوکلئوتید بودند. ژن های شناسایی شده به خصوص آن دسته از ژن هایی که الگوهای متفاوت تغییر نوکلئوتیدی در شترها نشان دادند را احتمالا می‌توان گزینه‌هایی برای مطالعه روند تکامل در این حیوانات قلمداد کرد.

Investigation of SNPs in genes related to lipid and glucose metabolism in the genome of dromedary, domestic Bactrian and wild Bactrian camels

The aim of the present study was to identify the SNPs located in the genes that are associated with lipid and glucose metabolism in the genome of Dromedary, domestic and wild Bactrian camels. For this purpose, firstly, important genes that related to lipid (15 genes) and glucose (17 genes) metabolism in mammalian were identified using DDD analysis and also reviewing of the authentic papers. In order to evaluate the accuracy of selected genes, gene ontology analysis was performed on them and significant lipid and glucoserelated terms were observed. In the next step, common SNPs among three Dromedaries (993,474), four domestic Bactrian (1,246,741) and two wild Bactrian camels (2,586,654) were extracted, identification and classification were done for SNPs of studied genes in the whole genome of three camel species. The results showed that the most of the identified SNPs are located in the intron, upstream and downstream of the genes that considered as regulatory variants. Some genes showed different pattern of SNPs among three specises, so that, several genes had SNPs in some species and no variant in other species. Identified genes, especially those that showed different variant pattern in camels, may be considered as options for studying of evolution presses of these animals.