بررسی ژنتیک جمعیت، فیلوژنی و تعیین خط شناسه dna در لاک پشت سبز (chelonia mydas) دریای عمان، سواحل استان سیستان و بلوچستان

در گذشته از صفات مورفولوژیکی برای طبقه بندی موجودات استفاده می کردند، اما امروزه استفاده از نشانگرهای مولکولی به دلیل مزیت هایی که دارد مورد توجه قرار گرفته است. نشانگرهای میتوکندریایی یکی از بهترین گزینه ها در بررسی روابط فیلوژنتیک است. در این مطالعه 10 نمونه از لاک پشت دریایی سبز از سه منطقه چابهار 4 نمونه، گواتر 3 نمونه و کنارک  3 نمونه در استان سیستان و بلوچستان جمع آوری شد. پس از استخراج dna با استفاده از کیت استخراج و هم چنین روش استخراج استات آمونیوم، نمونه ها از قطعه ژنی mtdna و coi توالی یابی شدند. توالی ها به کمک نرم افزارهای mega، bioedit و arlequin بررسی شدند. نتایج نشان داد که براساس آنالیز فیلوژنتیکی جمعیت مورد مطالعه، نمونه ها در سه جمعیت قرار گرفتند. میانگین کلی فاصله در میان جمعیت براساس pdistance برابر با 0/18 بود. نتایج کلاستال دابلیو نشان داد که بیش  ترین تفاوت میان توالی ها مربوط به ابتدا و انتهای توالی است. میزان تنوع هاپلوئیدی صفر بود. هم چنین تعداد محل های پلی مورفیک برابر با صفر بود که نشان می دهد تفاوت به اندازه ای نبوده که اشتقاق گونه انجام شود. هیچ نوترکیبی در توالی ها رخ نداده که با ماهیت ناحیه مورد بررسی هم خوانی داشته باشد. نتایج حاصل از این مطالعه را می توان در بررسی تنوع ژنتیکی لاک پشت های سبز دریایی در شرایط متفاوت جغرافیایی مورد استفاده قرار داد. هم چنین در مدیریت جمعیت این گونه، جلوگیری از انقراض آن و در تهیه یک بانک ژنی مناسب برای شناسایی این گونه به کمک تکنیک های مولکولی به ویژه در مواردی که فقط تخم یا بافت این گونه موجود است نیز می تواند یک راهکار مناسب باشد.

Population genetics, phylogeny and DNA barcoding of Sea Turtles (Chelonia mydas) in the Oman Sea (Sistan & Baluchestan province coasts)

In the past, morphological traits were used to classify organisms, but because of the problems encountered in classification using this method, the use of molecular markers was due to its advantages. Mitochondrial markers are one of the best options for the study of phylogenetic relationships. In this study, 10 specimens of green sea turtle were collected from three areas of Chabahar, Govater and Konarak in Sistan and Baluchestan province. After DNA extraction, the samples were sequenced. Sequences were studied using MEGA, BioEdit and Arlequin software. The results showed that based on the phylogenetic analysis of the studied population, all of the samples were placed in three populations. The average distance of the population with the help of Pdistance was 0.18. The results of the Clustal W show that the greatest difference between the sequences is at the beginning and the end of the sequence. The amount of haploid variety was zero, and the number of polymorphic sites was zero, which indicates that the difference was not such as to make the species derivative. No recombination has taken place in sequences that are consistent with the nature of the area under study. The results of this study, can be used to study the genetic diversity of marine turtles in different geographical conditions. It can also help to manage this population and prevent extinction. It can also be a good solution to provide a suitable Gene bank for the identification of this species through molecular techniques, especially in cases where only the eggs or meat of this animal is present.