|
|
|
|
تنوع ژنتیکی سنجاب زمینی زرد spermophilus fulvus (lichtenstein, 1823) در ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
اصغرزاده افسانه ,کابلی محمد ,رجبی مهام حسن ,نادری مرتضی
|
|
منبع
|
محيط زيست جانوري - 1399 - دوره : 12 - شماره : 4 - صفحه:161 -170
|
|
چکیده
|
هدف از این مطالعه بررسی تنوع، تغییرات و ساختار ژنتیکی جمعیت های سنجاب زمینی زرد (spermophilus fulvus) در ایران است. بدین منظور 79 نمونه بافت این گونه از هفت استان (خراسان رضوی، خراسان شمالی، زنجان، قزوین، البرز، همدان و کردستان) جمع آوری شد. پس از استخراج dna و واکنش زنجیره ای پلی مراز، تنوع ژنتیکی با استفاده از توالی کامل ژن سیتوکروم b (1140 جفت باز) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج درخت بایزین و حداکثر درست نمایی بر پایه این ژن برای 79 فرد نشان داد که سنجاب زمینی زرد (s. fulvus) با توزیع جغرافیایی وسیع از شرق تا غرب ایران شامل سه تبار فیلوژنتیکی است. تبار اول مربوط به شرقی ترین جمعیت های این گونه در نوار مرزی ایران و افغانستان بوده و تبار دوم و سوم شامل سایر جمعیت های این گونه از استان های شمال شرقی تا غرب ایران شامل خراسان رضوی، خراسان شمالی، زنجان و کردستان و نیز قزوین، البرز و همدان است. بررسی ها وقوع گسترش ناگهانی در جمعیت های این گونه را تصدیق نمود. 26 هاپلوتایپ منحصر به فرد و 35 جایگاه متغیر از نتایج بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های ایرانی سنجاب زمینی زرد بوده و این گونه در ایران تنوع هاپلوتایپی و ژنتیکی بالایی را براساس ژن میتوکندریایی مذکور نشان داده است. تجزیه واریانس مولکولی و شاخص fst ساختار ژنتیکی متفاوت و معنی داری را در بین جمعیت ها مشخص ساخته است. درنهایت درنظر گرفتن یک واحد تکاملی معنی دار برای هر تبار مجزای این گونه برای اهداف مدیریت حفاظت سنجاب زمینی زرد در ایران و نیز برای تداوم بقای آن پیشنهاد می گردد.
|
|
کلیدواژه
|
سنجاب زمینی زرد، spermophilus fulvus، تنوع ژنتیکی، جمعیت‌ها، نشانگر میتوکندریایی
|
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست, گروه محیط زیست, ایران, دانشگاه تهران, دانشکده منابع طبیعی, گروه محیط زیست, ایران, دانشگاه شهید بهشتی, دانشکده علوم و فناوری زیستی, گروه علوم و زیست فناوری جانوری, ایران, دانشگاه اراک, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه علوم محیط زیست, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genetic diversity of the Yellow ground squirrel Spermophilus fulvus (Lichtenstein, 1823) in Iran
|
|
|
|
|
Authors
|
Asgharzadeh Afsaneh ,Kaboli Mohammad ,Rajabi Maham Hassan ,Naderi Morteza
|
|
Abstract
|
To study the genetic diversity of the Yellow ground squirrel (Spermophilus fulvus) in Iran, 79 tissue samples were collected from seven provinces (Razavi Khorasan, North Khorasan, Zanjan, Qazvin, Alborz, Hamedan and Kurdistan). Following DNAisolationandpolymerase chain reaction (PCR), genetic variation was investigated using the complete sequencingof the mitochondrial Cytochrome b (cyt b) (1140 bp). Results of Bayesian and maximum likelihood trees based on cyt b using 79 individuals showed that the Yellow ground squirrel was divided into three main mtDNA clades from eastern to western Iran. Clade IR1 included populations from eastern and northeastern Iran, along with individuals from IranTurkmenistanAfghanistan borderline. Clade IR2 included populations from northeastern and western provinces of Iran (North Khorasan, Razavi Khorasan, Zanjan, and Kurdistan provinces), whereas Clade IR3 included populations from western Iran (Hamedan, Qazvin, and Alborz provinces). Our study reveals Iranian populations of the Yellow ground squirrel have undergone sudden range expansions. Based on the genetic diversity analyses, 26 unique haplotypes and 35 informative sites were detected, implying high levels of genetic and haplotype diversity. Additionally, an analysis of molecular variance (AMOVA) and fixation index (FST) confirmed a significant genetic structure among the main groups and populations. Finally, our results, based on the mitochondrial genealogy, recommend that the distinct clades of S. fulvus should be recognized as ESUs and be the focus of conservation efforts in the hope of securing the longterm persistence of the Yellow ground squirrel in Iran.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|