|
|
|
|
شناسایی مولکولی اویستر جنس saccostrea در سواحل شمالی خلیج فارس با استفاده از ژن coi میتوکندری
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
فخری علی ,نبوی محمد باقر ,حسینی جواد ,ذوالقرنین حسین ,ارچنگی بیتا
|
|
منبع
|
محيط زيست جانوري - 1399 - دوره : 12 - شماره : 3 - صفحه:415 -420
|
|
چکیده
|
اویسترهای صخره ای به طور وسیعی در سراسر دنیا گسترده شده اند، با وجود این تا کنون شناسایی و طبقه بندی آن ها به دلیل تغییر پذیری زیاد ریخت شناسی پوسته که متکی به ریخت شناسی موجودات است، مشکل می باشد و در اکثر موارد با خطا همراه است. برخلاف رده بندی که متکی به ریخت شناسی موجودات می باشد، روش های مولکولی می تواند به شناسایی و طبقه بندی گونه هایی که از نظر ریختی دارای ساختارهای مشابه می باشند کمک کند. در این تحقیق تعداد 15 نمونه اویستر صخره ای غالب، از مناطق جزر و مدی شمال خلیج فارس به منظور شناسایی مولکولی جمع آوری شدند. شناسایی بر اساس ریخت شناسی تا حد جنس (saccostrea) تعیین گردید. استخراج dna از بافت ماهیچه با استفاده از روش ctab انجام گرفت. توالی نوکلئوتیدهای زیر واحد 1 ژن سیتوکروم اکسیداز (coι) بررسی شد. توالی های نمونه های مورد مطالعه با توالی 16 گونه دیگر موجود در بانک ژن از طریق ترسیم درخت فیلوژنی مقایسه شد. بررسی فیلوژنی از طریق آنالیز neibour joining نشان داد نمونه های بررسی شده، گونه خواهری s. mordax ماداگاسکار در اقیانوس هند است و با s. mordax دیگر مناطق در دو کلاد جدا قرار گرفته اند. با توجه به نتایج این پژوهش، می توان گفت بر اساس توالی یابی ژن coi، گونه مذکور احتمالاً saccostrea mordax می باشد که در این صورت برای اولین بار در این منطقه گزارش شده است.
|
|
کلیدواژه
|
فیلوژنی مولکولی، اویستر صخره ای، خلیج فارس، سیتوکروم اکسیداز (coι)
|
|
آدرس
|
دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه بیولوژی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه بیولوژی دریا, ایران, دانشگاه خلیج فارس, پژوهشکده خلیج فارس, گروه شیلات و بیولوژی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه بیولوژی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه بیولوژی دریا, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Molecular phylogeny of rocky oyster (Saccostrea) in the northern part of Persian Gulf
|
|
|
|
|
Authors
|
Fakhri Ali ,Nabavi Seyed Mohammad Bagher ,Hoseini Seyed Javad ,Zolgharnein Hossein ,Archangi Bita
|
|
Abstract
|
Although rocky oysters are widespread throughout the world, they are still difficult to identify and classify due to their high levels of plasticity. Unlike morphological classification, molecular methods can help identify and classify species whose morphological characteristics are misleading. In this study, 15 dominant rocky oyster specimens were collected from intertidal areas of northern part of Persian Gulf to investigate the gene sequence. DNA was extracted from muscle tissue using CTAB (Hexade cyl trime thyl ammonium bromide) method. Sequences of unit 1 nucleotides of cytochrome oxidase gene (COI) were examined. The sequences of the studied samples were compared with the sequences of eight other species in the gene bank by phylogenetic tree mapping. The percentage of Bootstrap endemic to Saccostrea mordax is located in a clade, indicating that the COI sequence is suitable for identifying the species of Saccostrea oistre, and this species has also been reported for the first time in this area.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|