بررسی تنوع ژنتیکی و اثر انتخاب ژن های Rna ریبوزومی و ناقل در ژنوم میتوکندری شترهای تک کوهانه و دو کوهانه

حفاظت از ذخایر ژنتیکی با آگاهی از ساختار ژنتیکی و بررسی ژنوم میتوکندری بین و درون گونه ای یک شاخص مناسب از میزان تنوع ژنتیکی جهت مطالعه ژنتیک جمعیت است. از آن جائی که که ژن های غیرکدکننده 16srna،12srna و trna ها عناصر تنطیمی درگیر در همانندسازی و رونویسی میتوکندری می باشند. در این پژوهش توالی های 2  rrnaو 22 trna موجود در ژنوم میتوکندریایی شترهای تک کوهانه و دوکوهانه مقایسه و مورد تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی قرارگرفت. نتایج نشان دادکه در مقایسه توالی ژن های rna غیرکدکننده شترهای تک کوهانه و دوکوهانه 46 نوکلئوتید در توالی 16srna، 45 نوکلئوتید در 12srna و 44 نوکلئوتید در trna ها متغیر می باشد که تنها 2 ژن rrna و 4 ژن از trna ها نسبت به تست های تکامل خنثی معنی دار بودند. بررسی پیامدهای ساختاری این نوکلئوتیدهای متغیر با استفاده از مدل سازی تایید کرد که تنها نوکلئوتیدهای متغیر در حلقه d از ژن trnatrp سبب تغییر شکل فضایی ساختار برگ شبدری trna تریپتوفان و انرژی آزاد گیبس می شود. براساس تجزیه و تحلیل های این پژوهش ژن های rna غیرکدکننده ژنوم میتوکندری گونه های شتر حفاظت شده اند.

Study of Genetic diversity and selection effect on ribosomal RNA and transfer RNA genes in the mitochondrial genome of one humped camel and twohumped camel

The conservation of genetic resources using knowledge of the genetic structure and the study of mitochondrial genome between and within species is an appropriate indicator of genetic diversityfor population genetic study and Noncoding genes of 16sRNA, 12sRNA, and tRNAs are regulatory elements involved in mitochondrial replication and transcription. For these reasons, in the current research, sequences of 2 rRNAs and 22 tRNAs were compared and analyzed with bioinformatics analysis of the mitochondrial genome in one humped camel and twohumped camel. The results showed that 6 nucleotides of 16sRNA sequence, 45 nucleotides of 12sRNA and 44 nucleotides of tRNAs were varied in comparing the sequences of noncoding RNA genes of onehumped and twohumped camels, which only two genes of rRNA and four genes from tRNAs were significant for Neutrality tests. Investigating the structural implications of these variable nucleotides using modeling confirmed that only the variable nucleotides in the D ring of the tRNATrp gene caused the spatial deformation of the cloverleaf form of tryptophan tRNA and Gibbs’ free energy. Based on the results of this research, noncoding RNA genes of mitochondrial genome of camel species are conserved.