|
|
|
|
شناسایی هاپلوگروه های مادری جمعیت اسب های استان اردبیل با استفاده از ناحیه کنترل ژنوم میتوکندریایی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عمری کولانکوه مصطفی ,هدایت ایوریق نعمت ,بوستان آزاده ,سید شریفی رضا ,واحدی وحید ,خلخالی ایوریق رضا
|
|
منبع
|
محيط زيست جانوري - 1398 - دوره : 11 - شماره : 2 - صفحه:63 -68
|
|
چکیده
|
حفظ نژادهای بومی از اهداف مهم اصلاح نزادی محسوب می‌شود و جهت شناسایی ساختار ژنتیکی جمعیت باقی مانده اساس حفظ نژادی است. لذا این پژوهش با هدف بررسی ساختار ژنتیکی اسب های استان اردبیل و مقایسه با دیگر نژادهای خارجی با استفاده از ناحیه کنترل (d-loop) ژنوم میتوکندریایی انجام گرفت. جهت انجام آزمایش dna ژنومی استخراج و مستقیماً پس از تکثیر 430 جفت بازی از ناحیه کنترل با استفاده از روش سنگر از 100 راس اسب بومی مربوط به استان اردبیل توالی یابی گردید. آنالیز توالی‌ها منجر به شناسایی 43 جایگاه چندشکلی شد که منجر به ایجاد 40 هاپلوتیپ مختلف گردید که براساس هاپلوگروه های شناسایی شده در 9 هاپلوگروه (a،b ،c ، g ،i ،l ،m ،p و q) قرار گرفتند. مقدار تنوع نوکلئوتیدی، تنوع هاپلوتیپ و dتاجیما در اسب های بومی استان اردبیل به ترتیب 0/02412، 0/877 و 0/571 به دست آمد. میزان d تاجیما انحراف معنی‌داری را نشان نداد. نتایج این مطالعه نشان داد که خط مادری در اسب های اردبیل از تنوع بالایی برخوردار است.
|
|
کلیدواژه
|
اسب بومی، هاپلوتیپ، تنوع نوکلئوتیدی، تنوع ژنتیکی، ژنوم میتوکندریایی
|
|
آدرس
|
دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی مغان, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی مغان, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی مغان, گروه علوم دامی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Maternal Haplogroup identification of horse population in Ardabil province using mitochondrial control region
|
|
|
|
|
Authors
|
Omri kolankoh Mostafa ,Hedayat Evrigh Nemat ,Boustan Azadeh ,Seyedsharifi Reza ,Vahedi Vahid ,khalkhali evrigh Reza
|
|
Abstract
|
Conservation of indigenous animal is one of the main goals of animal breeding and identification of genetic structure of population is the basis for breed conservation. The aim of this study was to evaluate the genetic structure and the genetic relationship between native horses’ in Ardabil Province using mitochondrial Dloop region. Blood samples were collected from 100 horses. Total DNA was extracted and 430 bp of DLoop region (hyper variable) were amplified and sequenced using Sanger sequencing method. The analysis of data led to identify 48 polymorphic sites that create 52 haplotypes. The plotted phylogenic tree for haplotypes of Iranian native horses is placed in the 9 haplogroups including A, B, C, G, I, L, M, P and Q. Genetic and haplotype diversity values were 0.0241 and 0.877, respectively. Tajima D was calculated 0.571 which was not significant (p>0.1). Results of this study indicated that the maternal line of Ardabil horses had high genetic diversity.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|