|
|
بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی روباه معمولی (vulpes vulpes) در شمال شرق ایران براساس ژن سیتوکروم b
|
|
|
|
|
نویسنده
|
ایمانی هرسینی جلیل ,رضایی حمیدرضا ,نادری سعید ,وارستهمرادی حسین
|
منبع
|
محيط زيست جانوري - 1395 - دوره : 8 - شماره : 4 - صفحه:25 -34
|
چکیده
|
به منظور بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی روباه معمولی (vulpes vulpes)در شمال شرق ایران، 25 نمونه بافت از سه استان (خراسان رضوی، خراسان شمالی و گلستان) جمعآوری شد. پس از استخراج dna، ژن سیتوکروم b توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، تکثیر و پس از خالصسازی و توالییابی، قطعهای به طول 1098 جفت نوکلئوتید از این ژن برای هر نمونه ویرایش شد. سپس با تجزیه و تحلیل این قطعه در نمونهها، جایگاههای چندشکلی، تنوع هاپلوتایپی و نوکلئوتیدی، میزان تفاوت ژنتیکی براساس آماره fst، گسترش و پراکنش تاریخی جمعیت با سه روش شاخص راجرهارپندینگ، آزمون تاجیما و آزمون fu fs محاسبه شد و درخت فیلوژنتیکی براساس منطق بیزین و هم چنین شبکه هاپلوتایپی با منطق اتصال میانه رسم شد. نتایج نشان داد که 13 هاپلوتایپ متفاوت و 22 جایگاه متغیر در بین نمونهها وجود دارد و تنوع هاپلوتایپی برابر با 0/88 است. مقدار آماره p<0/05)fst) برابر با 0/6382 بود که با توجه به این مقدار و نتایج تجزیه و تحلیل واریانس مولکولی، جریان ژنی قوی بین جمعیتها وجود نداشته و هر جمعیت تا حدی متمایز از جمعیتهای دیگر است. درخت فیلوژنتیکی رسم شده بیانگر این مسئله است که ساختار ژنتیکی مستقلی برای جمعیتهای مورد بررسی، قابل تشخیص است و شبکه هاپلوتایپی رسم شده نیز این نظر را تایید میکند. بر همین اساس میتوان گفت تاریخ تکاملی روباه معمولی پیچیده بوده و الگوی پراکنش این گونه در شمال شرق ایران حاصل یک فرآیند بسیار طولانی است.
|
کلیدواژه
|
ساختار ژنتیکی، تنوع ژنتیکی، روباه معمولی، سیتوکروم b، شمال شرق ایران
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات, دانشکده محیط زیست و انرژی, گروه زیستگاه ها و تنوع زیستی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابعطبیعی گرگان, دانشکده محیط زیست و شیلات, گروه محیط زیست, ایران, دانشگاه گیلان, دانشکده منابع طبیعی, گروه محیط زیست, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابعطبیعی گرگان, دانشکده محیط زیست و شیلات, گروه محیط زیست, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Surveying the structure and genetic diversity of red foxes in the North East of Iran, based on cytochrome b gene
|
|
|
Authors
|
Imani Harsini Jalil ,Rezaei Hamid Reza ,Naderi Saeid NADERI ,Varasteh Moradi Hossein
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|