بررسی جهش در اینترون 2 ژن لپتین در گاوهای بومی و آمیخته گیلان به روش pcr-rflp

ژن لپتین به ‌عنوان یک ژن کاندیدا و تنظیم‌ کننده مهم در فرآیندهای مرتبط با صفات اقتصادی شناخته شده است. در این تحقیق، به منظور شناسایی چندشکلی ژن لپتین از 200 راس گاو نژاد بومی و آمیخته استان گیلان خون‌گیری شد. استخراج dna به‌ روش نمکی و تکثیر یک قطعه‌ 522 جفت بازی این ژن توسط واکنش زنجیره ‌ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی صورت گرفت و سپس با آنزیم محدودگر bsaai هضم و نمونه‌ ها تعیین ژنوتیپ شدند. برای جایگاه مورد مطالعه دو الگوی باندیa و b به ‌ترتیب با فراوانی 0/455 و 0/545 در گاو بومی و 0/365 و 0/635 در گاو آمیخته شناسایی شد. فراوانی‌ ژنوتیپ ‌های مشاهده شده aa، ab و bb به‌ ترتیب 0/19، 0/53 و 0/28 در گاوهای بومی و 0/14، 0/45 و 0/41 در گاوهای آمیخته به ‌دست آمد. براساس نتایج آزمون مربع‌ کای، جمعیت‌ های مورد بررسی در تعادل هاردی واینبرگ قرار داشتند. شاخص‌های نئی و شانون، هتروزیگوتی مشاهده شده و مورد انتظار به ‌ترتیب 0/496 و 0/689، 0/53 و 0/498 در گاو بومی و 0/464 و 0/656، 0/45 و 0/466 محاسبه گردید. نتایج این مطالعه نشان داد که این ناحیه از ژنوم در گاوهای مورد مطالعه چندشکل بوده و تکنیک pcr-rflp توانای شناسایی چندشکلی‌ ها را دارد.

Study of mutation in Second Intron of the bovine leptin gene in Guilan native and crossbreed cows using PCRRFLP

The leptin gene has been known as a candidate gene and a key regulator of processes that is related to economic traits. In order to study the polymorphism of Leptin gene, total blood samples were collected  randomly from 200 of native and crossbreed cows of Guilan province. DNA was extracted using salting out procedure and polymerase chain reactions (PCR) were carried out using a specific primer pairs for amplification a 522 bp fragment of leptin gene. Amplified fragment was digested by BsaAIrestriction enzyme and then samples were genotyped. For the studied locus Two patterns of A and B were identified with the frequency of 0.455 and 0.545 in native cows and 0.365 and 0.635 crossbreed cows, respectively. Three genotypes of AA, AB and BB with the frequency of 0.19, 0.53 and 0.28 in native cows and 0.14, 0.45 and 0.41 in crossbreed cows were detected, respectively. The chisquare test results showed that the studied populations was in HardyWeinberg equilibrium. Nei and Shanon indexes, observed and expected heterozygosities were calculated as 0.496 and 0.689, 0.53 and 0.498 in native cows and 0.464 and 0.656, 0.45 and 0.466 in crossbreed cows, respectively. The results revealed that the marker site of Leptin gene is polymorph in studied cows and the PCRRFLP technique  has  a  great  potential  for  detection  of  such  polymorphism.