association study of esr1 rs9340799,rs2234693, and mmp2 rs243865 variants in iranian women with premature ovarian insufficiency: a case-control study

Background: primary ovarian insufficiency (poi) is a rare disease clinically characterized by ovarian follicles depletion or dysfunction and menopause before the age of 40 yr as the cut-off age for poi. it is a complex disease, and its etiology involves several factors. however, genetic factors have a predominant role in the susceptibility to the disease. objective: this study aims to investigate the polymorphisms of rs243865 in the matrix metallopeptidase 2 (mmp2) gene and rs2234693 and rs9340799 in the estrogen receptor 1 (esr1) gene with susceptibility to poi in iranian women under 35 yr. materials and methods: this case-control study was performed on 150 women with poi and 150 healthy women who were referred to yazd reproductive sciences institute, yazd, iran between may-october 2020. the genotyping of esr1 rs9340799, rs2234693, and mmp2 rs243865 polymorphism was done using tetra-amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction. in addition, haplotype analysis and linkage disequilibrium were investigated by snpanalyzer software. results: our study revealed the frequency of rs243865 tt, cc genotypes in the mmp2 gene and rs2234693 cc, tt; and rs9340799 gg, aa in the esr1 gene were more prevalent in the case group compared to the control group. in addition, esr1 rs2234693 and rs9340799 genotypes showed significant association with the development of the disease in our population. among 4 haplotypes for 2 polymorphisms in the esr1 gene, rs2234693t/rs9340799a haplotype was associated with conferring risk to poi. conclusion: esr1 rs2234693 and rs9340799 polymorphism were strongly associated with our population’s poi.

بررسی ارتباط واریانت های rs9340799، rs2234693 در ژن ESR1 و rs243865 در ژن MMP2 در زنان ایرانی مبتلا به کاهش زودرس ذخیره ی تخمدان: یک مطالعه ی مورد-شاهدی

مقدمه: کاهش زودرس ذخیره­ی تخمدان (POI) یک بیماری نادر است که از نظر بالینی با کاهش یا اختلال در عملکرد فولیکول­های تخمدان در نظر گرفته  می­شود و همچنین یائسگی قبل از 40 سالگی به عنوان سن مد نظر برای POI مشخص می­شود. این یک بیماری پیچیده است و عوامل متعددی در اتیولوژی آن دخیل هستند. با این حال، عوامل ژنتیکی نقش غالب در استعداد ابتلا به این بیماری دارند.هدف: هدف این مطالعه بررسی ارتباط ژنتیکی پلی­مورفیسم­های rs934079 و rs2234693 در ژن ESR1 و rs243865 در ژن MMP2 با ریسک ابتلا به بیماری POI در زنان ایرانی می­باشد.مواد و روش ­ها: این مطالعه موردشاهدی بر روی 150 زن مبتلا به POI و 150 زن سالم (از آبان 1398 تا اردیبهشت 1399) انجام شد. ژنوتایپینگ         پلی­مورفیسم­های ژن rs934079 ESR1، rs2234693 و در ژن MMP2 rs243865 با استفاده از تکنیک TARMSPCR انجام شد. همچنین آنالیز هاپلوتیپ و عدم تعادل پیوستگی (LD) توسط نرم افزار آنالیز SNP مورد بررسی قرار گرفت.نتایج: مطالعه ما نشان داد که فراوانی ژنوتیپ‌­های TT, CC پلی­مورفیسم rs243865 در ژن MMP2 و ژنوتیپ­های CC, TT در پلی­مورفیسم rs2234693 و ژنوتیپ­های GG AA در پلی­مورفیسم rs9340799 در ژن ESR1 در گروه کیس نسبت به گروه کنترل شیوع بیشتری داشتند. علاوه بر این، ژنوتیپ‌های rs2234693 و rs9340799 در ژن ESR1 ارتباط معنی‌داری با ایجاد بیماری در جمعیت ما نشان دادند (05/0 > p). در میان چهار هاپلوتیپ برای دو پلی­مورفیسم در ژن ESR1، هاپلوتیپ rs2234693T/rs9340799A با ایجاد خطر برای POI مرتبط بود.نتیجه ­گیری: پلی‌مورفیسم rs2234693 و rs9340799 در ژن ESR1 به شدت با ایجاد بیماری POI در جمعیت ما مرتبط بود.کلمات کلیدی: ماتریکس متالوپروتئیناز2، گیرنده استروژن1، کاهش زودرس ذخیره­ی تخمدان، ناباروری زنان.