the association between tnp2 gene polymorphisms and iranian infertile men with varicocele: a case-control study

Background: numerous researches have provided great evidence that revealed the relationship between varicocele and sperm dna damage.objective: because of the crucial role of nuclear transition proteins (tps) in sperm dna condensation and integrity, this casecontrol study was designed to study tnp2 gene nucleotide variations in iranian patients with varicocele.materials and methods: pcrsscp and dna sequencing were used to search for mutations in exons 1 2 of the tnp2 gene in 156 infertile patients with varicocele and 150 fertile men.results: the results of sequencing showed three variants at positions c.301c>t (p.r101c), c.391c>t (p.r131w), and g.ivs126g>c (rs8043625) of tnp2 gene. it was found that varicocele risk in men who have the cc genotype of g.ivs126g>c snp is higher than those who don't have these genotypes (according to codominant model, dominant model, recessive model, and overdominant model). the haplotypebased analysis showed that (c/c/t) and (c/t/t) haplotypes were a risk factor of in patients with varicocele compared to controls (or = 3.278, p = 0.000 and or = 9.304, p = 0.038, respectively).conclusion: because of the significant difference in the genotype and allele frequencies of g.ivs126g>c snp in the intronic region of tnp2 in patients with varicocele compared with controls and also because of the high conservation of this snp position during evolution, this snp may be involved in some important processes associated with the expression of this gene like mrna splicing, but the exact mechanism is not clear.

ارتباط بین پلی مورفیسم rs8043625 ژن TNP2 و مردان نابارور ایرانی مبتلا به واریکوسل

مقدمه: مطالعات متعددی ارتباط بین آسیب DNA اسپرم و واریکوسل را نشان می دهند.هدف: با توجه به نقش حیاتی پروتئین های انتقال هسته ای (TP) در تراکم و یکپارچگی DNA اسپرم، این مطالعه موردشاهدی برای بررسی تغییرات نوکلئوتید ژن TNP2 در بیماران نابارور ایرانی مبتلا به واریکوسل طراحی شد.موارد و روش ها: PCRSSCP و توالی DNA برای جستجوی جهش در اگزون های 1 و 2 ژن TNP2 در 156 بیمار نابارور مبتلا به واریکوسل و 150 مرد بارور بکار برده شد.نتایج: نتایج توالی یابی سه واریانت در موقعیت های C.301C> T (p.R101C)، C.391C> T (p.R131W) و g.IVS126G>C (rs8043625) در ژن TNP2 آشکار کرد. نتایج ما نشان داد که خطر واریکوسل در مردان مبتلا با ژنوتیپ CC g.IVS126G>C بالاتر از کسانی است که این ژنوتیپ ها را ندارند (بر اساس مدل هم غالبیت، مدل غالبیت، مدل مغلوب و بیش از حد غالب). تجزیه و تحلیل بر اساس هاپلوتایپ نشان داد که هاپلوتایپ های (C/C/T) و (C/T/T) عامل خطر در بیماران مبتلا به واریکوسل نسبت به گروه کنترل بود (به ترتیب 278/3 OR=، 000/0 p= و 304/9 OR=، 038/0p= ).نتیجه گیری: با توجه به تفاوت معنی دار فراوانی ژنوتیپ و آلل g.IVS126G> C در ناحیه اینترونی TNP2 در بیماران مبتلا به واریکوسل در مقایسه با گروه کنترل و همچنین با توجه به حفاظت شدگی زیاد این موقعیت، این SNP ممکن است در برخی از فرآیندهای مهم مرتبط با بیان این ژن مانند پیرایش mRNA دخالت داشته باشد اما مکانیسم دقیق مشخص نیست.