|
|
بررسی تنوع ژنتیکی برخی ارقام مرکبات شمال ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریز ماهواره
|
|
|
|
|
نویسنده
|
باباخانی بابک ,نقاشی یلدا ,حسینی بلداجی افشین ,هوشنی مهدیه
|
منبع
|
اكوفيزيولوژي گياهي - 1399 - دوره : 12 - شماره : 41 - صفحه:271 -280
|
چکیده
|
در این مطالعه تنوع ژنتیکی 29 رقم مرکبات شامل ارقام پرتقال، نارنگی، نارنج، پوملو و تیپهای طبیعی با استفاده از هشت جفت آغازگر ریز ماهوارهای مورد ارزیابی قرار گرفت. dna ژنومی استخراج شده از نمونه های گیاهی با این آغازگرها تکثیر و محصولات حاصل با استفاده از ژل پلی اکریل آمید الکتروفورز شدند. از مجموع 97 باند امتیازدهی شده برای نشانگر issr، تعداد 78 باند معادل 80/22 درصد باندها چند شکل بودند. بیشترین و کمترین درصد چند شکلی بهترتیب آغازگرهای issr-8 با 90% و issr-5 با 73% باند، چند شکل نشان دادند. متوسط مقدار pic در این آزمون 0/18 بود. بیشترین مقدار pic برای آغازگرهای issr-6 وissr-8 با 0/27 و کمترین میزان برای آغازگر issr-1 با 0/12 گزارش شد. بر اساس این مطالعه، دندروگرام حاصل از تجزیه خوشهای به روش upgma با ضریب تشابه تطابق ساده، ارقام مورد بررسی به پنج گروه اصلی طبقه بندی کرد.پوملو دربررسی ما در خوشهای مجزا قرار داشت. نشانگر مولکولی issr ، نارنگی انشو سوجی یاما و کلمانتین نولس را در دو گروه مجزا قرار داد. مشاهدات در مورد بررسی استفاده از نشانگرهای issr در تمایز ژنوتیپ ها مشخص می نماید که این نشانگر، قادر به تفکیک بین ژنوتیپ های بسیار نزدیک نیز می باشد و میتوان با کمترین اشتباهی ژنوتیپ هر رقم را ارزیابی نمود.
|
کلیدواژه
|
مرکبات، تنوع ژنتیکی، گروه بندی، نشانگر issr
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد یادگار امام خمینی, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن, گروه زیست شناسی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
mhoshani@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
The ggenetic diversity of some citrus varieties using microsatellite molecular markers
|
|
|
Authors
|
Babakhani B ,Naghashi Y ,Hosseini Boldaji A ,Hoshani M
|
Abstract
|
The genetic diversity of 29 varieties of citrus, including varieties of orange, mandarin, bergamot, pomelo and natural types through a variety of short repetitive sequences using 8 microsatellite markers were evaluated. Genomic DNA extracted from the samples using the amplification and products using polyacrylamide gel electrophoresis instruments were Vasrshth. A total of 97 bands were scored formarker ISSR, 78 bands were polymorphic bands of 22/80 percent. The highest and lowest percentage ofpolymorphic ISSR-8 primers respectively with 90% and 73% polymorphic ISSR-5, respectively. The average value of PIC was 18/0 in this test. Most of the PIC into primer ISSR-6 and ISSR-8 with 27/0 and lowest primer ISSR-1 with 12/0 respectively. Study dendrogram of cluster analysis UPGMA method with simple matching coefficient, cultivars classified into five main groups. Pomelo in our study were in a separate cluster. ISSR molecular marker Satsuma mandarin and clementine Nvls Suji Yama were grouped into two distinct groups. Views about the use of ISSR markers to differentiate genotypes indicate that the indicator is able to differentiate between genotypes are very close and with the fewest mistakes possible genotypes evaluated each figure.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|