|
|
آنالیزفیلوژنتیکی جمعیت بزهای خلخالی با استفاده ژن سیتوکروم b
|
|
|
|
|
نویسنده
|
دولتی قره درویش لو ویدا ,هدایت ایوریق نعمت ,نیک بین سعید ,بهمرام رضا
|
منبع
|
بيوتكنولوژي كشاورزي - 1396 - دوره : 9 - شماره : 3 - صفحه:75 -86
|
چکیده
|
بز خلخالی یکی از بزهای بومی ایران است که درحال حاضرجمعیت آن بهشدت کاهش یافته است. برای حفظ و بهبود تولیدات این گونه مطالعات کاربردی ژنتیکی ضروری است. تحقیق حاضر باهدف توالی یابی ژن میتوکندریایی سیتوکروم b در 100 راس بز خلخالی و آنالیز بیوانفورماتیک این ژن در گونه های مختلف بز (با استفاده از 26 نمونه توالی ncbi) انجام شده است. جهت انجام آنالیز از روش توالی یابی ژن و مقایسه آن با اطلاعات موجود در پایگاه اطلاعاتی ncbi استفاده گردید. نتایج آنالیز تنوع ژنتیکی درجمعیت بز خلخالی منجر به شناسایی 5 جهش با 6 هاپلوتایپ مختلف گردید میزان تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و میانگین تفاوتهای نوکلئوتیدی به ترتیب 644/0، 002/0 و 822/1 برآورد شد. مقدار تاجیما d در جمعیت بزهای خلخالی مثبت 124/0 بدست آمد که ازلحاظ آماری معنیدار نبود. نتایج تجزیه تحلیلهای بین گونه های مختلف بز نشان داد که تنوع نوکلئوتیدی در گونههای بز ایبکس، ایگاگروس و هیرکوس به ترتیب 047/0، 022/0 و 001/0 می باشد. بیشترین فاصله ژنتیکی بین بزهای ایبکس و ایگاگروس و کمترین فاصله ژنتیکی بین گونه خلخالی و بز هیرکوس مشاهده شد. بزهای ایگاگروس در مقایسه با بزهای ایبکس ازلحاظ فاصله ژنتیکی به بزهای اهلی هیرکوس نزدیکتر بودند.
|
کلیدواژه
|
آنالیز بیوانفورماتیک ,، بز خلخالی ,، تنوع ژنتیکی ,، توالی یابی ,، ژن سیتوکروم b
|
آدرس
|
دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه محقق اردبیلی, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
nhedayat@uma.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|