بررسی فیلوژنتیکی جدایه های جدید ایرانی ویروس بادنای یک انجیر بر اساس ترادف ژن پروتئین حرکتی

بیماری موزائیک انجیر گسترش جهانی دارد و به عنوان شایع ترین بیماری ویروسی در انجیر شناخته می شود. یکی از مهمترین ویروس هایی که در این بیماری نقش دارد، ویروس بادنای یک انجیر (fbv 1) می باشد. در تحقیق حاضر، روابط فیلوژنتیکی بین جدایه های ایرانی و سایر جدایه های گزارش شده از این ویروس مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن رمز کننده پروتئین حرکتی ویروس، قطعه ی مورد انتظار به اندازه تقریبی 1090 جفت باز از ژنوم ویروس تکثیر شد. قطعه ژنی 12 جدایه در پلاسمید ptz57r/t همسانه و تعیین توالی شد. ترادف های به دست آمده با ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه و پس از همردیف سازی چندگانه، درخت فیلوژنتیکی بر اساس ژن پروتئین حرکتی fbv 1 ترسیم شد. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایه های fbv 1 در دو گروه متمایز دسته بندی شدند و جدایه های ایرانی در دو زیرگروه با 99% مشابهت نوکلئوتیدی در گروه اول قرار گرفتند. در بررسی تبارزایی بر مبنای توالی اسید آمینه ای، جدایه های مورد بررسی در سه گروه با 99 98 % مشابهت قرار گرفتند. جدایه های ایرانی از تنوع ژنتیکی پایین تری در مقایسه با جدایه های آمریکایی برخوردار بودند و شرایط جغرافیایی در تنوع ژنتیکی جدایه های موجود تاثیر داشت.