بررسی ساختار و لایه بندی جمعیت گاومیش های اکوتیپ آذری و شمالی با نشانگرهای متراکم چند شکل تک نوکلیوتیدی با استفاده از روش های admixture، gc، pca و mds

در کاربردهای ژنتیک جمعیت، اختصاص افراد به جمعیت های مربوط به خود اهمیت دارد. با توسعه تکنولوژی تعیین ژنوتیپ در مقیاس وسیع بسیاری از نشانگرها از جمله اسنیپ ها برای این مطالعات قابل دسترس شده اند که این اسنیپ ها در مطالعه تنوع ژنتیکی دام های اهلی و ساختار جمعیت سودمند هستند. هدف این تحقیق بررسی ساختار و لایه بندی گاومیش های مناطق مختلف دو اکوتیپ آذری و شمالی با استفاده از داده های snpchip 90 با روش های معمول بررسی ساختار جمعیت بود که برای این منظور تعداد 258 گاومیش از استان های آذربایجان شرقی، آذربایجان غربی و اردبیل مربوط به اکوتیپ آذری و از استان گیلان مربوط به اکوتیپ شمالی نمونه گیری و تعیین ژنوتیپ شدند. نتایج حاصل از کنترل ژنومیک لایه بندی ضعیفی با =1.056? نشان داد که حاکی از وجود اختلاط (ساختار ضعیفی) در بین دو اکوتیپ است. پلات های حاصل از تجزیه مولفه های اصلی و مقیاس بندی چند بعدی، تفکیک این دو اکوتیپ و استان های مختلف دو اکوتیپ را براساس فواصل انجام داد. روش admixture نیز نزدیکی فاصله ژنتیکی افراد استان های مختلف دو اکوتیپ را نشان داد که البته افراد خالصی هم در این بین وجود داشتند و k=3 خطای اعتبارسنجی پایینی داشت. این روش ها قادر به جداسازی کلی حیوانات به توده های مربوطه بودند و نتایج این تحقیق گویای ارتباط ژنتیکی نزدیک افراد چهار استان مختلف از دو اکوتیپ آذری و شمالی بود