تعیین توالی ژنوم کامل و فیلوژنی جدایه های نژاد شدید ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی جدا شده از تاتوره Datura stramomum L. در منطقه بجنورد، ایران

ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی , tylcv) tomato yellow leaf curl virus) به همراه ده گونه ویروسی و نژادهایشان که به ویروس های شبه tylcv معروفند عامل خسارت به گوجه فرنگی (solanum lycopersicum l.) در مناطق گرمسیر، نیمه گرمسیر و معتدل دنیا می باشند. در این بررسی تعداد سه جدایه tylcv-il از گیاهان تاتوره در منطقه بجنورد همسانه سازی و ژنوم کامل آنها تعیین توالی گردید. توالی اسید نوکلییک ژنوم کامل آنها به همراه تعداد نه جدایه tylcv-il گزارش شده ازایران و هشت توالی سایر ویروس های begomovirus گوجه فرنگی از ایران و سایر مناطق دنیا مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی جدایه ها نشان داد که تکامل جمعیت نژاد tylcv-il در ایران وابسته به جغرافیا بوده و صرفنظر از گونه میزبان واریانت های شمال شرق و جنوب ایران به طور مجزا در دو زیرگروه جداگانه قرار گرفتند. جدایه tylcv-il[ir:sh40:07], guo76444 از منطقه شیراز با هیچکدام از جمعیت های شمال شرق و جنوب ایران گروه بندی نشد. این جدایه با نژاد تیپ tylcv-il گزارش شده از فلسطین اشغالی قرابت نزدیکی داشته و با یکدیگر در یک زیر گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج تجزیه فیلوژنی نشان داد که این جدایه از نظر تکاملی به عنوان پل ژنتیکی بین جدایه-های tylcv-il حوزه مدیترانه ای و ایران محسوب می شود. این اولین گزارش از گیاه تاتوره به عنوان میزبان نژاد tylcv-il در ایران و همچنین حضور این نژاد ویروسی در منطقه بجنورد و استان خراسان شمالی می باشد.